Nat Cancer:王红阳/陈磊团队绘制肝细胞癌单细胞分辨率空间原位蛋白图谱,揭示肝细胞癌微环境空间异质性
利用CODEX技术,研究人员对401名HCC患者的肿瘤样本进行36种抗体染色,分辨率达0.377 μm/pixel,一共获得了4,347,731个细胞,定义了72个细胞表型以及40个细胞邻域关系。
2024-10-03
Dev Cell:余逸群/余洪猛/刘环海/任雯雯绘制嗅上皮衰老的单细胞转录组图谱
该研究建立了哺乳动物嗅上皮衰老的单细胞转录组图谱(图1),解析嗅上皮细胞类型特异性的衰老相关差异表达基因,发现衰老导致嗅上皮中存在激活型HBC,揭示Egr1和Cebpb是转录调控网络中的核心因子。
2024-08-27
Genome Biol:杨力组开发基于深度学习的计算分析框架实现RNA测序数据直接鉴别RNA编辑与DNA突变位点
DEMINING框架通过嵌入的深度学习模型DeepDDR,实现了从RNA测序数据中高效、精确地鉴定RNA编辑和DNA突变。
2024-10-16
Nat Immunol:缪小平/田剑波团队绘制肿瘤微环境中免疫细胞遗传调控图谱并揭示其作用模式及早筛应用价值
这项研究明确了机体胚系遗传变异在肿瘤微环境异质性中的作用,提供了最全面的肿瘤免疫浸润遗传调控图谱,揭示了胚系变异可能通过调控免疫反应在肿瘤发生和进程中发挥着关键作用。
2024-09-11
Nature Metabolism:ASS1通过代谢调节p53介导的DNA损伤反应,在DNA损伤中扮演关键角色
实验结果表明,ASS1是一个代谢检查点,在DNA损伤后,它通过限制核苷酸合成和p53相关基因转录来阻断细胞周期进程,从而实现基因组的维持和存活。
2024-07-29
Nat Commun:新研究首次绘制出人类大脑的脂质组图谱
来自斯科尔科沃科学技术学院的研究人员绘制了世界上第一张人脑脂质图谱。他们研究了四个健康人的脑组织样本,评估了大脑 75 个不同部位的脂质组成。
2024-07-11
Nature子刊:武汉大学缪小平/田剑波团队绘制肿瘤微环境中免疫细胞遗传调控图谱并揭示其作用模式及早筛应用价值
这项研究明确了机体胚系遗传变异在肿瘤微环境异质性中的作用,提供了最全面的肿瘤免疫浸润遗传调控图谱。
2024-09-13