新框架Systema诞生，揭示基因扰动预测的真实难度
研究人员为此开发了“Systema”框架，其核心思想在于一个巧妙的转变：改变评估的参考点(reference point)。
2025-08-29
Nature Biotechnology：D-I-TASSER——深度学习与物理模拟“联手”，蛋白质预测超越AlphaFold
在CASP15盲测中，D-I-TASSER表现惊艳，在单域和多域蛋白质预测上均展现出卓越性能，超越了AlphaFold2和AlphaFold3！
2025-05-28
Alzheimers Dement：人类疱疹病毒HSV-1可能通过转座因子导致阿尔茨海默病
HSV（包括HSV-1和HSV-2）和其他HHV是老年疾病的危险因素，但尚未得到充分的研究。间接证据表明HSV-1与阿尔茨海默病有关，但这些现象是如何联系在一起的，目前还没有解释。
2025-03-03
上海交大/清华大学合作开发AI模型，通过视网膜照片预测中风风险
在这项最新研究中，研究团队开发了一种深度学习系统——DeepRETStroke，这是一个专用于表征眼-脑连接的领域特定基础模型。
2025-06-10
Cell子刊：上科大刘雪松团队开发DeepMeta模型，为不可成药癌症预测代谢靶点
该研究开发了一种基于图深度学习的代谢脆弱性预测模型——DeepMeta，能够基于转录组和代谢网络信息准确预测癌症样本的依赖代谢基因，可为那些具有不可成药驱动突变的癌症提供代谢靶点。
2025-07-13
Front Cell Dev Biol：RAX2基因通过调控关键因子主宰视网膜光感受器细胞发育
本研究利用人类视网膜类器官和单细胞测序，发现RAX2缺失会影响光感受器细胞命运决定，其可能通过调控PAX6和SOX2表达参与视网膜发育，为相关视网膜疾病提供潜在治疗靶点。
2025-06-25
Nature：解码基因调控——GET模型如何颠覆传统预测方法
该研究旨在从染色质开放性数据和基因序列信息中学习调控规则，实现对基因表达的高精度预测。该模型的推出标志着转录调控研究进入了一个全新的阶段。
2025-01-13
