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单细胞和空间转录组中环形RNA深度学习算法取得进展

CIRI-deep可以实现多种转录组测序数据中差异剪接环形RNA的可靠预测,并在单细胞及空间水平实现细胞类型特异环形RNA的准确解析,具有广泛的应用场景。

2024-02-21

Mol Psychiatr:构建出新的狂犬病病毒载体用于绘制神经回路图谱

新的重组狂犬病病毒载体旨在靶向神经元生物学中的特定成分,以分析阿尔茨海默病和其他脑部疾病中发生的病理变化。

2024-02-24

科研人员出小麦穗发育的转录调控因子

中国科学院遗传与发育生物学研究所研究员肖军团队通过结合多维组学、群体遗传学和基因功能解析等研究手段,提出了系统高效鉴定关键调控因子的策略。

2024-02-07

华中科技大学研究者们揭示了核AGO2通过激活ANKRD1转录促进衰竭心脏心肌重塑

本研究结果表明,在压力超负荷诱导的衰竭心脏中,核AGO2表达上调,它在细胞核中作用于ANKRD1转录。ANKRD1具有双面性,胞浆形式位于肌节的I带区域,而胞浆形式诱导病理性MYH7激活和心脏重塑。

2024-03-27

Cancer Discov | 北京大学汤富酬/周鑫揭示了结直肠癌分子亚型的表观遗传基础和特征转录因子

该研究系统地揭示了著名的iCMS和CIMP分类的CRCs的表观遗传学基础。

2024-03-12

Cell:我国科学家构建出灵长类动物在妊娠期间的多组织代谢组图谱

在这项新的研究中,这些作者想知道灵长类动物在怀孕期间代谢系统会发生什么变化。

2024-02-23

Cell:新研究构建出雌性小鼠生殖道细胞图谱,有望探究雌性生育能力带来的长期后果

作者建立了一种模型,在这种模型中,生殖道在整个生殖生命周期中的反复重塑推动了纤维化和慢性炎症的年龄相关性逐渐发展。

2024-02-28

Nat Biotechnol | RNA结构解析新纪元:一种全新的自动化、高效率的冷冻电镜图谱分析方法

该研究开发了一种基于深度学习的方法,从冷冻电镜图中自动构建全长全原子RNA结构,称为EMRNA。

2024-03-08

Cell子刊:李汉杰/陈昶/王光锁/陈云团队绘制早期肺腺癌免疫动态图谱,揭示Tfh细胞抗肿瘤机制

在这项研究中,为了阐明肺腺癌发展过程中的免疫动态和调节机制,研究团队对34个正常肺样本、4个浸润性原位腺癌、22个微浸润性腺癌等的免疫浸润进行了时间分辨单细胞RNA测序分析。

2024-03-11

CELL RESEARCH:解码人类脊髓发育过程中转录因子的时空调控

在发育中的人类脊髓中发现的 DAM 样小胶质细胞与多项研究中观察到的特化小胶质细胞群有显著的相似性。

2024-01-31