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Cell:樊荣团队开发全球首个临床级福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样本的空间全转录测序技术

在约2300种已知的人类成熟microRNA中,Patho-DBiT在MALT切片中检测到了1352种microRNA,其映射序列的长度峰值为21个核苷酸,与此类小RNA的已知长度完全一致。

2024-10-04

深度学习与空间转录学的完美结合

GASTON通过结合无监督的深度神经网络与可解释性算法,创新性地提出了“等深度”(Isodepth)的概念。

2025-02-01

David Baker创立的AI制药公司扔出重磅炸弹:最大规模单细胞扰动测序数据集,支持虚拟细胞研究

Xaira Therapeutics 的研究人员证明,sgRNA 的丰度在每个细胞中能被检测到并表达数百个拷贝,这在单细胞检测中极为罕见,并且为基因被抑制的程度提供了一个可靠的替代指标。

2025-06-19

细胞测序解锁人类系统性硬化症治疗新策略

研究结果表明,外周血单核细胞患者的外周血单核细胞中存在显著的免疫细胞异常。

2025-06-25

Cancer Cell:徐淼/李贵登/曹素梅团队通过T细胞测序,实现鼻咽癌早期诊断

该研究首次通过大规模 T 细胞受体免疫组库测序,锁定鼻咽癌特异性 T 细胞克隆,构建了可提前 6-12 个月预警鼻咽癌发生的 T-score 模型,并揭示 EB 病毒与肿瘤抗原双重识别的免疫监视机制。

2025-05-10

Nature Genetics:任善成/谌科/古迪团队绘制首个成年人前列腺空间转录学图谱,揭示前列腺新的生理功能和癌变机制

该研究构建了首个高分辨率成年人前列腺空间图谱,系统解析了前列腺的空间异质性与细胞组成。

2025-04-04

Mol Cell:HOXDeRNA 通过与基因广泛结合激活癌症转录程序和超级增强子

HOXDeRNA通过rG4结构结合EZH2并招募到PRC2标记的基因组区域,从而去除PRC2对关键胶质瘤转录因子和超级增强子的抑制,最终激活多个癌症驱动基因,驱动星形胶质细胞向胶质瘤转化。

2024-11-07

Cell:叶子璐等开发单细胞蛋白学新技术,实现单细胞蛋白质周转的全局分析

该研究开发了一种单细胞蛋白质组学新技术——SC-pSILAC(单细胞脉冲稳定同位素标记),首次在单细胞水平实现了蛋白质丰度与蛋白质周转速率的同步精准测量,为细胞异质性的研究提供了全新的维度与视角。

2025-04-05

Science:剪接体对RNA转录本的编辑延迟会导致细胞死亡

在这项新的研究中,这些作者如今发现了一种以更微妙的方式干扰剪接过程的机制。它与剪接体的一个由三种亚基U4、U5 和 U6组成的特定部分有关。

2024-11-28