质谱技术有新用——临床样本的数字化进程
近日，来自瑞士的科学家在国际著名生物学期刊nature medicine 发表了他们的一项最新研究成果，他们结合压力循环技术（PCT）和SWATH-MS技术提出一种将临床组织样本转换为单个数字文件的方法，应用这种方法对样本的蛋白组学信息进行记录，方便研究人员对样本信息进行反复分析和对比。这一方法的提出对增加临床样本的利用效率具有重要意义。活体组织检查（biopsy）简称"活检"，是指应
科学家发表非编码RNA相互作用数据库NPInter v4.0
非编码RNA对生物分子的调控作用，一直是RNA功能研究的前沿。在以往的研究中，非编码RNA被发现可以和蛋白质、RNA以及基因组相互作用，调控复杂生物过程。比如经典的长非编码RNA Xist可以和X染色体相互作用并影响剂量补偿效应。理解非编码RNA和生物分子的相互作用对于研究非编码RNA的功能以及生物分子调控网络的构建是非常重要的。10月31日，《核酸研究》（Nucleic Acids
研究开发表观组关联分析数据库
近日，由中国科学院北京基因组研究所国家基因组科学数据中心开发的人类表观组关联分析数据库EWAS Data Hub正式上线。该项研究成果以EWAS Data Hub： a resource of DNA methylation array data and metadata 为题在国际学术期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在线发表。近年来，表观组关联分析（Epigeno
Science子刊：揭示麻疹病毒感染导致B细胞库受损，从而导致长期的免疫抑制
2019年11月10日讯/生物谷BIOON/---麻疹病毒（measles virus, MeV）是一种高度传染性的淋巴细胞病毒。麻疹是一种由麻疹病毒感染引起的疾病，可导致病毒血症和淋巴细胞减少。麻疹相关皮疹消失后不久，淋巴细胞数量会恢复，但是感染后的免疫抑制作用可持续数月至数年，导致继发感染的发生率增加。动物模型和体外研究已提出了导致这种长期免疫损伤的各种免疫学因素，但是在人类中起作用的确切机制
研究人员发布全基因组单核苷酸变异数据库
10月22日，国际学术期刊Genome Biology 以PGG.SNV： understanding the evolutionary and medical implications of human single nucleotide variations in diverse populations 为题，在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所/马普计算生物学研究所徐书华团队基于20万人
研究开发水稻分子育种整合组学知识库
10月18日，中国科学院遗传与发育生物学研究所植物基因组学国家重点实验室梁承志研究组开发的分子育种整合组学知识库水稻子库在线发表于学术期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）。文章题目为MBKbase for rice： an integrated omics knowledgebase for molecular breeding in rice。种质资源是作物遗传改良的
研究揭示碱基编辑器的效能差异并构建可编辑致病突变数据库
近日，中国科学院上海营养与健康研究所杨力研究组与上海科技大学生命科学与技术学院陈佳研究组通过合作，系统揭示了一系列具有代表性的基因组碱基编辑器（baseeditor）的效能差异，并进一步构建了可利用20种已报道碱基编辑器进行编辑的人类疾病相关单碱基突变位点的数据库（BEable-GPS， Base Editable prediction of Global Pathogenic SNVs），相关成
科学家分离出近八千种人体消化道菌株样本
人体消化道是成千上万种不同细菌的家园。美国麻省理工学院和布罗德研究所目前已分离保存了近8000种人体消化道菌株的样本，并揭示了其遗传和代谢背景。相关研究发表在最新一期Nature Medicine上。研究小组在长达两年的时间里收集了大约90人的粪便样本，深入了解了微生物种群在个体内的变化情况。这项研究的重点是生活在波士顿地区的人们，但研究小组也在收集来自全球各地的更多样本，希望能够保留
Science子刊：对潜伏性HIV病毒库形成的新见解有助于开发出更好的疗法
2019年10月19日讯/生物谷BIOON/---抗逆转录病毒疗法（ART）可以将HIV病毒抑制到几乎无法检测到的程度，并且接受这种药物治疗的人可以活很多年。但是这种治疗不能彻底根除这种病毒；它持续存在于免疫细胞内的病毒库中，这种现象称为“潜伏（latency）”。即使一个人在感染后很早就开始治疗，这种潜伏性HIV病毒库仍会形成，但是人们在很大程度上尚不清楚这种病毒库形成的动态变化。如今，在一项新
中国临床试验能效指数核心指标库建立
中国临床试验能效指数（Clinical Trial Capability& Efficiency Index，以下简称CTCE Index）继6月正式启动以来，经过专家工作委员会全体成员100余天的研究探讨、分析修订，终于迎来了阶段性重大进展！