Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱:CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化
CalicoST算法的核心优势在于其能够从SRT数据中精确推断等位基因特异性拷贝数变异(allele-specific CNAs)。
2024-11-23
Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱,CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化
CalicoST算法的诞生填补了这一空白。它不仅能够从空间转录组数据中推断出肿瘤的等位基因特异性拷贝数变异,还能够重建肿瘤克隆在空间中的进化轨迹,绘制出肿瘤演化的“进化地图”。
2024-11-10
Mol Psych:睡眠不好,大脑“垃圾清理系统”也会“罢工”?科学家揭示老年人大脑健康的新秘密
本文研究不仅揭示了睡眠质量与胶质淋巴系统功能之间的直接联系,还进一步探讨了这种联系如何通过大脑网络影响记忆功能。
2025-03-26
大脑中的“园丁”与“杂草”Nature:利用空间转录组时钟揭示大脑衰老过程中的细胞邻近效应
这项研究表明,细胞之间的互动——而不仅仅是单个细胞的特性,在塑造衰老过程中起着关键作用。
2024-12-27
科研人员开发基于深度学习模型的空间转录组精细分辨率细胞注释算法
STASCAN提供了用于整合空间基因表达信息和组织学图像进行精细分辨率细胞注释的工具,在解码细胞空间精细分布和解析特异组织结构方面具有优势。
2024-11-10
Nat Genet:科学家开发出能识别驱动侵袭性癌症生长的肿瘤细胞的首个计算机算法
本文研究中,研究人员通过将SPRINTER算法应用于此前产生的61,914个乳腺癌细胞和卵巢癌细胞的数据集,揭示了不同基因组变异的单细胞率的增加,以及高增殖克隆群中与增殖相关的基因扩增的富集现象。
2024-12-26
研究揭示人类大脑皮层的复杂布局
研究通过对人类连接组学数据和遗传学数据的综合分析,发现了背腹轴、前后轴和内外轴三种主导的脑连接拓扑轴。这三个轴反映了皮层内连接的变化规律,且与胚胎期发育中的形态发生梯度和遗传梯度相关。
2025-02-25