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研究提出准确识别基因组间直系同源共线性的新方法

中国科学院昆明植物研究所研究员马永鹏团队联合国际、国内科研机构开发了直系同源指数(OI),以度量共线性的直系同源水平,其定义为种间共线性区块内直系同源基因的占比。

2025-05-02

研究揭示宿主基因组趋同是地下哺乳动物适应穴居生活的趋同演化基础

该研究从多组学视角探讨了地下哺乳动物适应洞穴环境的适应性演化和趋同演化机制,阐明地下哺乳动物穴居适应的趋同演化是由宿主基因组趋同而非肠道微生物组趋同驱动,为地下哺乳动物的适应性演化和趋同演化提供新认识

2025-08-26

Cell:基因组的“罗生门”——选错参考,我们对物种演化的理解可能错得离谱

该研究告诉我们,选错参考基因组,不仅仅是得到一个有些许误差的结果,而是可能让我们走进一个由数据构建的“镜中世界”,看到一个与现实截然相反的演化故事。

2025-09-26

有望破解人类基因组98%非编码“暗物质”,开启AI驱动基因调控研究新时代

《自然》杂志发表的评论文章称,AlphaGenome是破解基因组 98% 非编码“暗物质”的一把新钥匙。

2025-06-27

破解 "暗基因组" 密码!Science:发现一类能感知环境机械特性的特殊 DNA 片段

杜克大学的研究人员利用CRISPR技术,在"暗基因组"中发现了此前未被标注的DNA片段,这些片段负责控制细胞如何感知并响应其局部环境的机械特性。

2025-09-29

Nature:从基因组伤痕到转录组静默——单细胞多组学揭示大脑衰老的因果链条

研究为我们提供了一张前所未有的高分辨率地图,以前所未有的深度和广度,揭示了人类大脑在从婴儿期到百岁高龄的漫长旅程中,细胞层面发生的深刻变革。

2025-09-06

Nature Genetics:基因组淘金热!LDAK-KVIK如何打破遗传分析中的“速度与精度”魔咒?

LDAK-KVIK 的强大,不仅体现在最终的输出结果上,更体现在其设计过程中的诸多“智慧思考”。

2025-08-20

Nature:用条形码标记基因组中的顺式调控元件提供了对人类基因组的深入了解

在这项研究中,这些作者基于大规模实验数据,开发了几种机器学习模型来预测顺式调控元件(CRE)的调节活动。

2025-01-20

Nature:科学家揭示基因组倍增或会塑造卵巢癌的可进化性和免疫力

本文通过单细胞基因组学和转录组学技术揭示了全基因组倍增在卵巢癌中的动态变化及其对肿瘤进化和免疫反应的影响。

2025-07-20

PNAS:科学家利用人工智能成功识别出引发人类复杂疾病的关键基因组

来自美国西北大学等机构的科学家们通过研究开发了一种名为TWAVE的新型计算工具,其或有望彻底改变我们对复杂疾病的理解和治疗方式。

2025-06-11