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研究提出预测RNA聚合酶暂停位点的深度学习模型

  近日,清华大学交叉信息研究院的曾坚阳研究组成功开发了能在全基因组上预测RNA聚合酶暂停位点的深度神经网络模型,该研究为Pol II暂停现象在转录过程中的调控机制提供了一个全新的分析框架,也为在缺乏测序数据的细胞系上研究Pol II暂停提供了很好的预测参考模型。真核生物的转录是一个高度复杂且被准确调控的动态过程,RNA聚合酶II(RNA

2021-02-03

研究揭示RNA病毒聚合酶具有一个与宿主适应相关的特征区域

  RNA病毒编码的依赖RNA的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,简称RdRP)是一类独特的核酸聚合酶,在病毒基因组复制和转录过程中发挥核心作用,是抗病毒药物研究的热点靶标。病毒的RdRP由于可与其他功能域融合或与其他病毒蛋白共折叠,其整体结构多样性较高,但其催化核心区的三维结构则较为保守,因此RdR

2021-01-20

揭示Rho让RNA聚合酶失活终止转录新机制

2020年11月29日讯/生物谷BIOON/---基因表达分为转录阶段和翻译阶段。科学家们之前一直并不知道在细胞中,DNA转录一旦开始,是如何被正确关闭的。在转录过程中,一种称为RNA聚合酶的酶将自身包裹在DNA的双螺旋周围,使用一条DNA链与核苷酸匹配以形成遗传物质的副本---一条新合成的RNA链,该RNA链的合成在转录完成后会释放出来。所产生的RNA可以

2020-11-29

揭示核仁RNA聚合酶II促进核糖体合成

2020年7月22日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自加拿大多伦多大学的研究人员发现一种名为RNA聚合酶(Pol)II的酶促进核糖体构成单元(building block)的产生,其中核糖体是根据遗传密码制造细胞内所有蛋白的分子机器。相关研究结果于2020年7月15日在线发表在Nature期刊上,论文标题为“Nucleolar RNA pol

2020-07-22

我国科学家从结构上揭示瑞德西韦抑制新冠病毒RNA依赖性RNA聚合酶机制

2020年5月23日讯/生物谷BIOON/---由SARS-CoV-2病毒引起的COVID-19大流行已成为一场人道主义危机,截至2020年4月8日报告的感染人数超过150万,死亡人数超过8.7万,到2020年4月27日已迅速增加到感染人数超过299万和死亡人数20.7万。SARS-CoV-2与严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV)和β冠状病毒家族中

2020-05-23

bioRxiv:人肺细胞和小鼠实验证实瑞德西韦高效抑制SARS-CoV-2的RNA聚合酶表达!

2020年5月10日讯 /生物谷BIOON /——SARS-CoV-2于2019年出现,成为导致新型大流行性病毒性疾病COVID-19的病原体。由于没有获得批准的治疗方法,本次大流行表明迫切需要针对SARS-CoV-2和未来出现的CoV的安全、广谱抗病毒对策。来自北卡罗来纳大学教堂山分校等单位的研究人员近日报告了瑞德西韦--腺苷类似物的一种单磷酸氨基甲酯前药可

2020-05-10

我国科学家发表Science论文,揭示SARS-CoV-2病毒RNA依赖性RNA聚合酶的三维结构,助力开发新的疫苗和药物

2020年4月23日讯/生物谷BIOON/---由新型冠状病毒SARS-CoV-2(之前称为2019-nCoV)引起的2019年冠状病毒病(COVID-19)于2019年12月出现,此后成为全球大流行病。据报道,SARS-CoV-2是β冠状病毒(betacoronavirus)属的一个新成员,与严重急性呼吸综合征(SARS)冠状病毒(SARS-CoV)和几种

2020-04-23

研究揭示细菌RNA聚合酶转录起始后期的动态过程

3月3日,国际学术期刊《美国国家科学院院刊》(PNAS)在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心合成生物学重点实验室张余研究组与美国Rutgers University的Richard Ebright研究组合作完成的题为RNA extension drives a stepwise displacement of an initiation-factor

2020-03-08

研究人员揭示RNA聚合酶在大肠杆菌细胞内的空间组织及其与转录的关系

  2019年9月16日,PNAS杂志在线发表了约翰霍普金斯大学医学院肖杰博士团队的研究成果,题为“Spatial organization of RNApolymerase and its relationship with transcription in Escherichia coli”。该工作揭示了RNA聚合酶(RNAP)簇的特征及其在细胞内空间分配模式不仅依赖于rR

2019-11-04

Nature:针对RNA转录和剪接的新观点!磷酸化调节着RNA聚合酶II对不同凝聚物的偏好性

2019年8月17日讯/生物谷BIOON/---细胞通常产生区室来控制重要的生物功能。细胞核就是一个很好的例子;它被核膜包围着,容纳着基因组。然而,细胞还含有未被膜包围的较为短暂存在的封闭室,就像水中的油滴。在过去两年中,这些称为液滴状“凝聚物(condensates)”的封闭室已越来越多地被认为是控制基因的主要参与者。如今,在一项新的研究中,来自美国怀特黑德生物医学研究所的研究人员发现凝聚物在剪

2019-08-17