Nature Biotechnolog:绘制剪接调控的“GPS”!KATMAP如何精准区分剪接调控的直接与间接效应?
KATMAP的诞生,不仅仅是为我们提供了一个分析数据的新工具,它更代表了一种从海量转录组数据中萃取生物学智慧的新范式。
2025-11-09
Nature Biotechnology:绘制剪接调控的“GPS”——KATMAP如何精准区分剪接调控的直接与间接效应?
KATMAP是一种全新的可解释性回归模型,能够仅凭剪接因子敲低后的RNA-seq数据和该因子的结合序列偏好 (binding motif),就能精准推断出其活性、调控靶点,并清晰地区分直接与间接效应。
2025-11-08
Nature:特定RNA修饰或会促进自身免疫性疾病的发展
本文研究揭示了RNA糖基化在免疫逃逸和细胞凋亡后清除中的关键作用;通过一系列体内外实验,研究人员证明了N-糖链能掩盖RNA上的acp3U从而阻止其激活TLR3和TLR7。
2025-08-10
Cell:泛修饰测序揭示核糖体表观遗传组的热调控机制
这项研究通过Pan-Mod-seq、PANORAMA和电镜分析等技术,首次系统揭示rRNA修饰的动态性与环境适应性,为后续进一步理解rRNA表观遗传组在健康和疾病状态中的作用铺平道路。
2025-12-01
Nature Genetics:变“在场”为“在岗”——基于剪接修复的活性筛选系统,重塑高分辨率碱基编辑扫描新范式
研究团队开发了一种基于“编辑活性”的共筛选方法,它如同一枚精准的“试金石”,能够特异性地富集那些编辑真正“在岗工作”的细胞,从而将筛选的信噪比提升到了一个全新的水平。
2025-10-21
Science子刊:卞修武团队发现增强CAR-T细胞抗肿瘤效果的基因修饰策略
该研究发现,敲低 NR4A3 可增强 CAR-T 细胞抗恶性胶质瘤的能力,但该能力会因持续抗原暴露诱导的 T 细胞耗竭而减弱,在此基础上增强 FOS 表达,能够逆转上述 T 细胞功能耗竭。
2025-10-26
Cell:新研究揭示mRNA的m6A修饰协助调控细胞应激反应机制
他们发现,暴露于抑制核糖体的化合物的细胞中,含 m6A 的信使 RNA 水平异常高,而正常情况下这种水平很低。这说明核糖体参与了降解携带m6A 的 mRNA 的过程。
2025-05-25
Nature子刊:姜海/邓贤明团队开发高通量蛋白降解剂筛选平台,成功发现SKP2分子胶降解剂
该研究开发了一种蛋白降解剂的新型高通量降解剂筛选平台——DEFUSE(DEath FUSion Escaper)。
2025-09-17
Blood:科学家成功破解罕见白血病的“基因密码”,揭示m6A修饰与Wnt信号通路的双重奏
研究人员通过多组学方法首次揭示了RBM15-MKL1融合蛋白如何保留RBM15的RNA结合和m6A修饰功能。
2025-09-03