| RNA分析类 | |
| RNA draw 1.1 b | 283k,RNA draw 1.1b2 RNA二级结构分析软件,对RNA一级序列进行二级结构分析作图,最有意思的是大部分功能集中在鼠标右键。RNA draw汉化版 336 K。原始网站。 |
| RNAstructure 3.71 | 1.1兆，Unix平台软件mfold的for Windows版本，输入或载入RNA的一级序列,根据最小自由能原理,依据一定算法,预测出其二级结构图，非常出色的一个程序。RNAstructure 3.2 中文帮助文件。 4K。原始网站。 |
| Tcl 8.3.2 ClassyTk1.0.exe RnaViz 2.0 |
2.5M,1.1M与1.1M。 界面友好的RNA二级结构图绘制程序。可生成发表质量的二级结构图，可显示一些特殊结构。全部下载后，依次安装以上三个软件。原始网址 |
| loopDloop 2.07b | 650K。Java语言写成的绘制RNA二级结构的软件，需要安装JAVA虚拟机。原始网站。 |
| Circles 0.1.0 | 1.4M。使用比较的方法分析RNA二级结构软件，并以标准格式输出预测的二级结构。原始网站。 |
| RNAFold | 200K。RNA二级结构分析软件。原始网站。 |
| SStructView 1.2 | 70K，用JAVA脚本语言写成的RNA二级结构显示软件，可嵌入到HTML中，用IE运行使用。原始网站。 |
| Vienna RNA Package | 维也纳大学RNA二级结构预测与比较软件包，全部下载共计5.8M。包括以下软件：RNAfold预测最小能量二级结构，并给出图像；RNAeval估算RNA二级结构的能量值；RNAheat计算一个RNA序列的融解曲线；RNAinverse.exe">RNAinverse预定结构的序列的反转折叠；RNAdistance比较二级结构；RNApdist比较碱基对的概率；RNAsubopt完善次优折叠。还有RNAalifold和RNAplot。原软件均为linux环境下的软件，作者编译成WINDOWS下可执行软件，但并未经过测试。作者同时提供C语言源文件，感兴趣的人可以自行在WINDOWS下编译。原始网站。 |
| 以上软件，除特别注明外，均在生物软件光盘5中。 |
