早在2002年6月，科技部、教育部联合颁发的《关于充分发挥高等学校科技创新作用的若干意见》的文件，就提出了“逐步培育和依托社会中介组织开展评价活动，建立独立的社会化科研评价体系”的中国科研评价的指导思想，确定了大学和科研单位的评价应由社会中介组织进行的具体方向。此次《科学时报》刊登的《2003中国一流研究生院》，就是由社会中介组织完成的中国一流研究生院评价。
中国一流研究生院代表中国最高学术水平。平时学习成绩优异，希望进入国内最好的研究生院接受一流的专业教育，在短时间内进入中国科学前沿，可报考中国一流研究生院。本次评价的中国一流研究生院的标准是：在中国研究生院评价中，获得工学前7名、理学前4名、医学前3名，农学前2名、管理学前3名、文学前3名、经济学前2名、法学前2名、历史学、教育学、哲学第1名的研究生院。中国一流研究生院各学科的入选数量根据各学科的博士生导师数量和开设该学科的院校数量确定。
按照以上标准，在我国413所大学、244个科研单位，共计657个研究生培养单位（不含军事院校、不含主要为军事工程服务的科研单位）中，有17所研究生院入选中国一流研究生院，其中科研单位3个，大学13个，还有1个既是科研单位又是大学，这就是中国医学科学院又名中国协和医科大学。
2003中国一流研究生院名单（共17所）
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中国科学院研究生院 |
理学第一名、工学第二名 |
中国社会科学院研究生院 |
经济学第一名、哲学第一名、历史学第一名、文学第二名、法学第二名 |
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清华大学研究生院 |
工学第一名、管理学第三名 | ||
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中国医学科学院研究生院 |
医学第一名 | ||
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中国农业科学院研究生院 |
农学第一名 |
北京大学研究生院 |
法学第一名、文学第一名、理学第二名、医学第二名 |
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西安交通大学研究生院 |
管理学第一名、工学第七名 | ||
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北京师范大学研究生院 |
教育学第一名 |
中国农业大学研究生院 |
农学第二名 |
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浙江大学研究生院 |
管理学第二名、工学第三名 |
南京大学研究生院 |
理学第三名 |
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中国人民大学研究生院 |
经济学第二名 |
复旦大学研究生院 |
医学第三名、文学第三名 |
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中国科学技术大学研究生院 |
理学第四名 |
上海交通大学研究生院 |
工学第四名 |
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华中科技大学研究生院 |
工学第五名 |
哈尔滨工业大学研究生院 |
工学第六名 |
一、科研单位一流研究生院
截至2002年，有研究生学位授予权的科研单位数量占我国研究生培养单位总数的37％，博士生导师数量占博导总数的15％但培养的研究生数量不足全国研究生总数的10％。这一方面说明大部分科研单位规模小，招生人数少，另一方面也说明在科研单位就读研究生，能得到导师更多时间的指导。
中国科学院研究生院 理学第一名、工学第二名
中国科学院研究生院是中国自然科学最高学府，其中理学以绝对优势领先全国各大学和科研单位。中国科学院研究生院的2653名博士生导师是中国科学院师资力量最真实的写照。中国科学院研究生院的数学、物理学、化学、天文学、地理学、地质学、生物学、力学、材料科学与工程、电子科学与技术、计算机科学与技术、核科学与技术等12个一级学科在全国范围内具有明显的优势。平时学习成绩优秀，有志短时间内进入上述学科国内前沿的考生，应以中国科学院这12个学科作为报考目标。
中国社会科学院研究生院 哲学第一名、经济学第一名、历史学第一名、法学第二名、文学第二名
中国社会科学院研究生院是中国社会科学最高学府，其中历史学、经济学以绝对优势领先全国各大学和科研单位。中国社会科学院研究生院的哲学、理论经济学、应用经济学、法学、政治学、社会学、中国语言文学、历史学等8个一级学科在全国范围内具有明显的优势。平时学习成绩优秀，有志短时间内进入上述学科国内前沿的考生，应以中国社会科学院这8个学科作为报考目标。
中国农业科学院研究生院 农学第一名
中国农业科学院研究生院是中国农学最高学府且以较大的优势居于全国大学和科研单位农学之首。中国农业科学院研究生院的作物学、植物保护学、畜牧学、兽医学等4个一级学科在全国范围内具有明显的优势。平时学习成绩优秀，有志短时间内进入上述学科国内前沿的考生，应以中国农业科学院这4个学科作为报考目标。
中国医学科学院研究生院（中国协和医科大学） 医学第一名。见中国协和医科大学。
二、大学一流研究生院
大学是我国研究生的主要培养群体。大学培养的研究生占我国研究生总数的90％以上。大学学科门类多，规模大。在大学就读研究生，可以在更宽广的范围内选修课程。
清华大学 工学第一名、管理学第三名
清华大学研究生院总分列全国大学研究生院第1名。清华大学在41个一级学科有研究生学位授予权，其中数学、物理学、生物学、力学、机械工程、光学工程、仪器科学与技术、材料科学与工程、动力工程及工程热物理、电气工程、电子科学与技术、信息与通信工程、控制科学与工程、计算机科学与技术、建筑学、土木工程、水利工程、化学工程与技术、核科学与技术、环境科学与工程、艺术学、管理科学与工程等22个一级学科为A++级。
北京大学 法学第一名、文学第一名、理学第二名、医学第二名
北京大学研究生院总分列全国大学研究生院第2名。北京大学在42个一级学科有研究生学位授予权，其中数学、化学、地理学、大气科学、生物学、计算机科学与技术、基础医学、临床医学、口腔医学、公共卫生与预防医学、哲学、理论经济学、应用经济学、法学、政治学、社会学、心理学、中国语言文学、外国语言文学、历史学、公共管理学等21个一级学科为A++级。
浙江大学 管理学第二名、工学第三名
浙江大学研究生院总分列全国大学研究生院第3名。浙江大学在61个一级学科有研究生学位授予权，其中数学、生物学、控制科学与工程、计算机科学与技术、土木工程、农业工程、园艺学、农业资源利用学、植物保护学、畜牧学、中国语言文学、农林经济管理学等12个一级学科为A++级。
复旦大学 医学第三名、文学第三名
复旦大学研究生院总分列全国大学研究生院第4名。复旦大学在32个一级学科有研究生学位授予权，其中生物学、基础医学、临床医学、公共卫生与预防医学、中西医结合医学、理论经济学、中国语言文学、新闻传播学、公共管理学等9个一级学科为A++级。
南京大学 理学第三名
南京大学研究生院总分列全国大学研究生院第5名。南京大学在38个一级学科有研究生学位授予权，其中物理学、化学、天文学、地理学、环境科学与工程、哲学、中国语言文学、外国语言文学、历史学、工商管理学等10个一级学科为A++级。
华中科技大学 工学第五名
华中科技大学研究生院总分列全国大学研究生院第6名。华中科技大学在43个一级学科有研究生学位授予权，其中机械工程、电子科学与技术、控制科学与工程、生物医学工程等4个一级学科为A++级。
上海交通大学 工学第四名
上海交通大学研究生院总分列全国大学研究生院第8名。上海交通大学在48个一级学科有研究生学位授予权，其中力学、机械工程、材料科学与工程、信息与通信工程、计算机科学与技术、船舶与海洋工程、生物医学工程、工商管理学等8个一级学科为A++级。
西安交通大学 管理学第一名、工学第七名
西安交通大学研究生院总分列全国大学研究生院第10名。西安交通大学在39个一级学科有研究生学位授予权，其中机械工程、动力工程及工程热物理、电气工程、管理科学与工程、工商管理学等5个一级学科为A++级。
哈尔滨工业大学 工学第六名
哈尔滨工业大学研究生院总分列全国大学研究生院第12名。哈尔滨工业大学在30个一级学科有研究生学位授予权，其中机械工程、仪器科学与技术、材料科学与工程、环境科学与工程等4个一级学科为A++级。
中国科学技术大学 理学第四名
中国科学技术大学研究生院总分列全国大学研究生院第13名。中国科学技术大学在33个一级学科有研究生学位授予权，其中数学、物理学、化学、地球物理学、科学技术史等5个一级学科为A++级。
中国协和医科大学 医学第一名
中国协和医科大学是中国医学科学院的别称，研究生院总分列全国大学研究生院第15名。中国协和医科大学在7个一级学科有研究生学位授予权，其中生物学、基础医学、临床医学、药学等4个一级学科为A++级。
北京师范大学 教育学第一名
北京师范大学总分列全国大学研究生院第24名。北京师范大学在30个一级学科有研究生学位授予权，其中系统科学、教育学、心理学、中国语言文学、艺术学、历史学、公共管理学等7个一级学科为A++级。
中国农业大学 农学第二名
中国农业大学研究生院总分列全国大学研究生院第29名。中国农业大学在28个一级学科有研究生学位授予权，其中农业工程、作物学、农业资源利用学、植物保护学、畜牧学、兽医学等6个一级学科为A++级。
中国人民大学 经济学第二名
中国人民大学研究生院总分列全国大学研究生院第30名。中国人民大学在20个一级学科有研究生学位授予权，其中理论经济学、应用经济学、政治学、社会学、新闻传播学、工商管理学等6个一级学科为A++级。
