上海南方模式生物研究中心是为适应人类基因组计划完成后所引发的全球性基因功能研究的热潮，由上海市科委发起，联合沪上多家从事相关研究的科研院校和科技企业，于2001年11月成立的一家利用转基因和基因剔除技术开展基因功能研究和开发疾病动物模型的科研机构。为有效利用现有资源，中心依托于2000年9月成立的国家863计划生物领域疾病动物模型研发基地暨上海南方模式生物科技发展有限公司，充分发挥研究中心的学术优势和企业管理的机制优势，在短时间内建立起了国内最具规模的模式生物研究基地。
中心由留美学者、教育部“长江学者奖励计划”特聘教授、中科院“百人计划”和国家杰出青年基金获得者王铸钢教授领衔，并聚集了一批学术造诣深、技术全面的海外留学人员和来自沪上相关高校、中科院的专业技术人才。中心现拥有现代化的分子生物学、细胞生物学、生物化学实验室和设施先进的显微注射室和较大规模的SPF级动物房。在短短的两年时间里，中心从无到有建成了高效稳定、国内
规模最大的转基因和基因剔除小鼠研发技术及相关生物学技术的公共服务平台。能够进行较大规模的基因克隆、质粒构建、鉴定、细胞转染、基因打靶、ES细胞建系、重组ES细胞克隆的筛选、DNA和ES细胞的显微注射、遗传工程小鼠的鉴定、动物表型分析、小鼠繁殖和保种、胚胎冻存和细胞核移植等。 中心以技术模块集成的流水线工作模式进行运转，可以达到每周产出一种转基因小鼠，两周产生一种基因剔除小鼠的规模。在国内外学术杂志上已发表重要科研论文37篇、已完成申报国内技术发明专利7项。目前，中心在承担国家和上海市科委下达的研究项目的同时已经并正在为国内外从事功能基因组学研究的高校、科研院所及生物技术企业提供全方位技术服务。
中心目前主要开展与神经精神系统疾病、肿瘤、糖尿病、骨质疏松症、心血管疾病等相关基因的功能研究及疾病动物模型的开发，尤其注重具有自主知识产权的功能基因。已研制出120余种遗传工程小鼠模型，其中转基因小鼠模型96种、基因剔除/敲入小鼠模型30种，在国际上首次以转基因动物证明了AML1-MTG16、NUP98-PMX1在小鼠造血组织中的特异性表达可引致转基因小鼠发生类似人类白血病的表型；在国际上首次发现PLAG1基因的高表达在唾液腺肿瘤发病中的作用；在国际上首次阐明了Rig-I、Rig-K和HCCS1等新基因在造血细胞发生、细胞增殖调控及胚胎发育中的重要作用；并正在建立ES细胞的大规模随机突变细胞库及相应数据库，为大规模功能基因的克隆及其功能研究建立资源储备。
中心正在围绕国家目标，致力于建立高效、大规模疾病动物模型研发公共服务平台，对我国重要疾病和具有自主知识产权的新基因或疾病相关基因进行模式生物体的研究和开发。中心将在上海市科委的领导下，以科技创新为动力、以关键平台技术为核心，广纳科技精英，广泛开展国内外科研合作，将基础研究与产业化开发紧密结合，为我国功能基因组学、生物医学及药学等领域研究水平的提高和相关产业的发展做出贡献，将尽快建设成为我国最重要的模式生物技术及功能基因组学的研究中心、信息中心、资源中心、人才培训中心及产业化中心。
