蛋白质组学的发展与挑战：生物谷访蛋白质组学专家—何大澄教授
何大澄教授系北京师范大学教授，高等学校蛋白质组学研究院首席科学家、院长，是知名的细胞生物学家和蛋白质组学专家。生物谷（Bioon.com）记者曾多次聆听何教授的精彩报告，对何教授渊博的专业及人文知识钦佩不已。近日生物谷（Bioon.com）作为受邀媒体特别参加了Bio-Rad在北京师范大学召开SELDI技术研讨会。期间有幸采访到了何大澄教授，就蛋白质组学的研究进展和应用前景进行了深入分析和探讨。
生物谷（Bioon.com）：Biomarker作为一个技术型的工具，您认为它对生命科学研究有什么样的意义？
何大澄教授：Biomarker（生物标志物）作为疾病诊断的工具，对于人类健康和医疗的意义是毋庸置疑的，显然能有助于更早、更明确地诊断出许多重要的疾病。这也是人们长期以来的梦想。目前蛋白质组学技术的发展，让这样的一个梦想的实现成为可能。虽然还没有能够完全做到最准确的预测，但已经给我们找到一个朝着这个方面发展的工具，并已经得到全世界的关注，无论是官方、民间还是科学界、企业界。前几年已经有很多人看到这一点了，但是直到近两年才受到了空前广泛的注意。2007年在韩国首尔召开的人类蛋白质组学组织年会上，特别以大会副标题的形式提出来这样的一个方向性的口号："From technical research to Biomaker application" , 要从大规模的技术性研究转向biomarker的研究，这是一个必然的趋势。但Biomaker研究的意义还不止于此，所以我们提出"From Markers to Keys", 把"标志物"变成理解和干预生命过程的"钥匙"。
生物谷（Bioon.com）：您能否介绍一下国内Biomarker的研究进展？
何大澄教授：国内也有很多家机构在研究biomarker，相关大学和研究院大部分都已经与医学单位、临床单位结合起来进行研究，并逐渐的都有所进展。虽然都是采用蛋白质组学方法，但具体技术途径和具体目标各有侧重，显示出一定的多元化。和国际上研究biomarker相比，我们有些项目和国际上基本同步，某些研究甚至比国外还早，但是总的进展速度上还有差距。目前在中国主要是国家在投入，而在欧美国家政府和企业都投入经费加以研究。我认为biomarker研究和企业的合作以及自身的产业化方面都应该加强，这也是必然的和必须的道路，因为biomarker确实可以造成一个很大的产业，会形成一个很大的市场，并能够创造很高的利润。我相信，一个有远见的相关企业，自然会在这个方面加大投入。目前很多的科学家科研人员都认识到，研究做的再好，如果忽略可能的产业化，就不能产生它应有的社会价值。对疾病biomarker来说，甚至就不能达到它的根本目标。现在看起来，中国的企业界也正在发生巨大的变化，从以前只注重短期的盈利行为，到现在注重企业的研发投入，总的说企业界的水平在提高，眼界在扩大，我希望能有更多的企业介入新兴的biomarker研究。
生物谷（Bioon.com）：您如何看待SELDI技术在Biomarker discovery中的应用前景？
何大澄教授： SELDI技术是一种以质谱为基础的新的蛋白质组学技术，在biomarker筛选方面具有自己明显的特色和优势。它是目前唯一能够在样品的数量和每个样品中同时观察蛋白种类数量这两个方面都可以达到高通量的一种技术，而其他的技术还不能同时在这两个方面达到高通量。要想广泛筛选biomarker，这种高通量的性质是很必要的。所以SELDI技术在这个方面有一定的优势。当然也还有一些其他的优势。比如，特别有利于直接产生多于一个的差异蛋白来组成所谓的"组合式样"，或者说组合biomarker。举例来说，即使我们能捕捉到一千个差异蛋白，但我们面对的疾病可能会比这还多，如果希望仅用一种蛋白来确定疾病的种类甚至疾病的病程阶段，几乎是不可能的。而这些biomarker所能形成的组合式样几乎是无限的。而且，我们也没有必要放弃一个可用的组合marker而非得要追求单一的marker，因为最后实际使用时，组合的marker并不比单一的marker麻烦。所以组合式的marker绝对有优势，看来将会是未来使用的主要形式。SELDI技术恰恰最适合产生这种组合的式样，这是SELDIseldi的另一优势，但这并不能说明它可以取代其他技术，或者说它就是最好的技术。SELDI技术本身不是分离技术或鉴定技术，也不是用来获取蛋白的技术，它就是一个比较技术，一个筛选差异的技术，所以对于筛选biomarker或其他差异蛋白，SELDI技术正好可以利用上其独有的优势。
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