杨焕明：有两代中国人不知DNA

生物谷

我国人类基因专家杨焕明作客电子科技大学，以《基因组学的新进展》为题作了精彩报告

　　杨焕明，年过半百，中国人类基因组专家。1999年，在他及其团队的努力下，为中国争取到了国际人类基因组计划1%的项目，随着该计划的提前完成，中国已成为“DNA科学的重要角色”。昨（14）日，杨焕明来到电子科技大学，参加在此举行的中国遗传学会功能基因组学研讨会，并作了以《基因组学的新进展》为题的精彩报告。

　　破天书我们才刚刚开始

　　“神六刚上天，又回来，让我们想起20世纪人类最伟大的登月计划，随着电脑芯片的出现，人类进入了信息时代。现在，人类已经进入另外一个时代———基因组时代。”杨焕明开场便为基因组时代的来临而欢呼。

　　“50多年前，DNA双螺旋结构的发现告诉我们：要揭开生命的奥秘，就得‘阅读’DNA序列。用通俗的话来说‘基因ABCD的排列，就是破译生命奥秘的关键所在’。”

　　1990年开始的人类基因组计划，就是一项专门测定DNA序列的计划。人类基因组序列“全书”的提前绘制完成，有助于我们进一步了解了生老病死的奥秘，人类和其他生物的DNA序列成为生命科学和生物技术的上游和源头。杨焕明说，现在人类依然处于基因组学的第一个阶段，了解生命的“天书”才刚刚开始。

　　忧患论　怕基因组学入歧途

　　“基因组学发展迅猛，但它带给我的担忧远远多于欢乐，我对该学科最担心的是唯基因论。几年前，偶然看到一篇国外的文章，里面写到4号染色体注定你找什么工作，某某号染色体是决定你是否聪明，某某号染色体决定你这辈子很有钱……我担心这种论调会将基因研究引入歧途。”紧接着，杨焕明话锋一转，“幸好刊登日期是4月1日。”

　　“而美联社有报道揭示称，某机构直接针对消费者做DNA测试，承诺将根据其DNA的情况进行量身定做，增添各种缺少的营养。事实证明，这些机构的做法完全没有科学依据。更有所谓的‘珍奥核酸’可以‘增强基因自主修复能力’的夸大宣传，这简直是对生命科学的嘲笑和嘲弄！”

　　杨焕明还提出了警惕生物恐怖主义以及由基因研究所带来的知识产权问题，“基因是人类共有的，每个国家都有资格谈论和研究。基因组学更多的是靠国际合作，因为它涉及的不仅是技术层面的问题，更多的是数据共享的问题。”

　　欢欣说我们理应后来居上

　　杨焕明表示，曾有两代中国人不知道DNA，而在这个时期内，其他国家却正享受着基因组学带来的各种好处，直到1998年，中国成为继法、德、日、美、英五国的最后一个人类基因序列图的贡献国家，参与了国际合作之后，中国的DNA研究逐渐有了起色。

　　“我们是后来者，后来者理应居上，在已经知道的基因组里面，我们已将日本超过，如今，对世界基因组工作作出的努力已跃居世界第三。”杨焕明时刻担心缩小的差距又将变大，“幸运的是，我们生正逢时，能看到基因组学给人类带来的种种好处和变化”。

　　亮明观点

　　我支持转基因食品

　　天府早报：最近有无什么基因组方面的计划？

　杨焕明：去年12月13日，美国的同事向国会递交的一份癌症基因组计划申请书获准通过，他们将对临床50种典型癌症，每年1000个病例的样本进行基因组测序。通过的次日，该计划的负责人给我发邮件，邀请我们参加。目前，这个计划已被纳入国家十一·五重大项目计划，估计这两天该计划就会公布。

　　天府早报：参加这个计划，对彼此来说有哪些好处？

　　杨焕明：这是国际上肿瘤研究合作的一部分，研究对象是那些对人体健康危害最大、发病率最高的肿瘤，对临床医学或研究提供基础数据。我们可以共享研究成果，比如数据、治疗药物等。

　　天府早报：目前，随着生物技术的迅猛发展，大量转基因生物及其产品被推向市场。“转基因”似乎已经不可逆转地大步迈入老百姓的日常生活，你如何看待它的安全性？

　　杨焕明：我是支持转基因食品的。目前，食品安全性评价有两个为国际上广泛接受与采用的原则：一是实质等同原则，二是个案分析原则。转基因农作物在全球大面积种植已有9年之久，食用转基因食品的人群超过10多亿之众，至今还没有关于转基因食品不安全的任何证据。

　　人物简介

　

杨焕明

杨焕明（Huanming Yang）
教授，所长，丹麦哥本哈根大学博士
电话：（010）80494969
E-mail: yanghm@genomics.org.cn

研究方向:

　　杨焕明教授一直从事基因组科学的研究。杨焕明领导华大中心经过艰苦的拼搏，在世界上首次利用全基因组“霰弹法”策略对大型植物基因组进行测序，独立完成了超级杂交水稻父本籼稻“9311”基因组（大小约为4.6亿个碱基对）的“工作框架图”。该项目的完成，建立和完善了基因组学、生物信息学和蛋白质组学研究的多个技术平台，其水平与发达国家齐步，使我国成为继美国之后的第二个具有全面测定和分析大型全基因组能力的国家，而且从无到有地开发了重复序列识别及注释系统，并率先公布了数据库，促进了“国际联盟”的工作进程，在国际上产生了巨大而深远的影响。

　　尤其在抗击非典行动中，带领年轻人团队，同舟共济，团结一心，在SARS冠状病毒的基因组研究及建立诊断方法上又做出了贡献，使我国的基因组研究走向了世界，得到了国内外同行与有关部门的肯定。

　　杨教授及其团队（“所承担的人类基因组、水稻基因组以及家猪、家鸡、家蚕基因组等重大项目使我国的基因组研究得以跻身于世界前沿。

主要科研成果:

　　杨焕明教授一直从事基因组科学的研究。他主持完成的 “人类基因组计划—中国卷”使中国成为这一被称为“二十世纪登月计划”的宏伟项目的成员国，得到了各国领导人和国际科学界的高度赞扬。杨焕明教授及其团队（“华大基因”）所承担的人类基因组、水稻基因组以及家猪、家鸡、家蚕基因组等重大项目使我国的基因组研究得以跻身于世界前沿。2003年，“华大基因”又在水稻基因组完成图、家蚕基因组“框架图”的绘制以及SARS冠状病毒的基因组研究及建立诊断方法都做出了新的成绩。杨焕明教授还特别关注基因组研究的社会影响和基因知识的普及。

学术职务:

　　1.“国家863计划”生物和现代农业技术领域专家委员会成员
　　2.“中国遗传资源管理办公室”专家委员会成员
　　3. 中国生物工程学会（CSBT）常务理事
　　4. 中国遗传学学会（CGS）理事会理事
　　5. 中华医学遗传学学会（CSMS）理事会理事
　　6.《遗传》杂志编委
　　7.《遗传学报》杂志编委
　　8.《国外医学：遗传学》（中国）编委
　　9. 国际“人类基因组单体型图（HapMap）计划”协作组中国协调人
　　10.欧洲全球生命科学促进会（EAGLES）委员

近期主要论文论著:

J. Yu, J. Wang, W. Lin, S. Li, H. Li, J. Zhou, P. Ni, W. Dong, S. Hu, C. Zeng, … G.K. Wong, H. Yang. The genomes of Oryza sativa: A history of duplications. PLoS Biology. 3:e38(0001-0016), Feb. 2005.
Jing Wang, Ximiao He, Jue Ruan, Mingtao Dai, Jie Chen, Yong Zhang,Yafeng Hu, Chen Ye, Shengting Li, Lijuan Cong, Lin Fang, Songgang Li, Jian Wang, David W. Burt, Gane Ka-Shu Wong, Jun Yu, Huanming Yang and Jun Wang. ChickVD: a sequence variation database for the chicken genome. Nucleic Acids Research. 33: D438–D441, 2005.
Jing Wang, Qingyou Xia, Ximiao He, Mingtao Dai, Jue Ruan, Jie Chen, Guo Yu, Haifeng Yuan, Yafeng Hu, Ruiqiang Li, Tao Feng, Chen Ye, Cheng Lu, Jun Wang, Songgang Li, Gane Ka-Shu Wong, Huanming Yang, Jian Wang, Zhonghuai Xiang, Zeyang Zhou and Jun Yu, SilkDB: a knowledgebase for silkworm biology and genomics. Nucleic Acids Research. 33: D399–D402, 2005.
Zongzhong Tong, Dongsheng Zhou, Yajun Song, Jian Wang, Jun Yu, Peitang Huang, Huanming Yang, and Ruifu Yang. Genetic variations in pgm locus among natural isolates of Yersinia pestis. The Journal of General and Applied Microbiology. 5, 2005 (In press).
Zongzhong Tong, Dongsheng Zhou, Yajun Song, …Jun Yu, Jian Wang, Peitang Huang, Huanming Yang, and Ruifu Yang. Pseudogene accumulation might promote the adaptive microevolution of Yersinia pestis. Journal of Medical Microbiology. 54: 259-268, 2005.
Skjoedt, Gane Ka-Shu Wong, Jun Wang, Bin Liu, Jian Wang, Jun Yu, Huanming Yang, Mikhail Nefedov, Maxim Koriabine, Pieter J. deJong. Sequence and comparative analysis of the chicken genome provide unique perspectives on vertebrate evolution. Nature. 432: 695-716, 2004.
International Human Genome Sequencing Consortium (Beijing Genomics Institute, Yang as the Coordinator-in-China). Finishing the euchromatic sequence of the human genome. Nature. 431:931-945, 2004.
Qingyou Xia, Zeyang Zhou, ……Jian Wang, Gane Ka-Shu Wong, Huanming Yang. A draft sequence for the genome of the domesticated silkworm (Bombyx mori). Science. 306:1937-1940, 2004.
International HapMap Consortium (Beijing Genomics Institute, Yang as the Coordinator-in-China). Integrating Ethics and Science in the International HapMap project. Nature Reviews Genetics. 5: 467-475, 2004.
Wenming Zhao, Jing Wang, Ximiao He, Yongzhi Jiao, Mingtao Dai, Shulin Wei, Jian Fu, Chen Ye, Xiaoyu Ren, Yong Zhang, Peixiang Ni, Jianguo Zhang, Songgang Li, Jian Wang, Gane Ka-Shu Wong, Hongyu Zhao, Jun Yu, Huangming Yang, Jun Wang. BGI-RIS: an integrated information resource and comparative analysis workbench for rice genomics. Nucleic Acids Research. 32: D377-D382, 2004.
Jiabin Tang, Hong’ai Xia, Mengliang Cao, Xiuqing Zhang, Wanyong Zeng, Songnian Hu, Wei Tong, Jun Wang, Jian Wang, Jun Yu, Huanming Yang and Lihuang Zhu. A comparison of rice chloroplast genomes. Plant Physiology, 135:412-20, 2004.
Yajun Song, Zongzhong Tong, Jin Wang, Li Wang, Zhaobiao Guo, Yanpin Han, Jianguo Zhang, Decui Pei, Dongsheng Zhou, Haiou Qin, Xin Pang, Yujun Han, Junhui Zhai, Min Li, Baizhong Cui, Zhizhen Qi, Lixia Jin, Ruixia Dar, Feng Chen, Shengting Li, Chen Ye, Zongmin Du, Wei Lin, Jun Wang, Jun Yu, Huanming Yang, Jian Wang, Peitang Huang, Ruifu Yang. Complete genome sequence of Yersinia pestis 91001, an isolate avirulent to humans. DNA Reserach. 11:179-197, 2004.
Li Y, Luo C, Li W, Xu Z, Zeng C, Bi S, Yu J, Wu J, Yang H. Structure-based preliminary analysis of immunity and virulence of SARS coronavirus. Viral Immunology. 17:528-34, 2004..
International HapMap Consortium (Beijing Genomics Institute, Yang as the Coordinator-in-China). The international HapMap project. Nature. 426: 789-796, 2003.
Wang Jian, Li Wei, Xu Zuyuan, Li Yan, Wu Qingfa, Lin Wei, Cheng Weijun, Tang Lin, Deng Yajun, Han Yujun, Li Changfeng,...and Yang Huanming, A complete sequence and comparative analysis of a SARS-associated virus(Isolate BJ01), Chinese Science Bulletin. 48:941-948, 2003.
Jingqiang Wang, Jie Wen, Jingxiang Li, Jianning Yin, Qingyu Zhu, Hao Wang, Yongkui Yang, E’de Qin, Bo You, Wei Li, Xiaolei Li, Shengyong Huang, Ruifu Yang, Xumin Zhang, Ling Yang, Ting Zhang, Ye Yin, Xiaodai Cui, Xiangjun Tang, Luoping Wang, Bo He, Lianhua Ma, Tingting Lei, Changqing Zeng, Jianqiu Fang, Jun Yu, Jian Wang, Huanming Yang, Matthew B West, Aruni Bhatnagar, Youyong Lu, Ningzhi Xu, Siqi Liu. Assessment of immunoreactive synthetic peptides from the structural proteins of SARS-coronavirus. Clinical Chemistry. 49: 1989-1996, 2003.
Jun Yu, Songnian Hu, Jun Wang, Gane Ka-Shu Wong,…. Jian Wang, Lihuang Zhu, Longping Yuan, Huanming Yang. A draft sequence of the rice (Oryza sativa ssp. indica) genome. Science. 296: 79-92, 2002.
Jun Wang, Gene Ka-Shu Wong, Peixiang Ni, Yujun Han, Xiangang Huang, Jianguo Zhang, Chen Ye, Yong Zhang, Jianfei Hu, Kunlin Zhang, Xin Xu, Lijuan Cong, Hong Lu, Xide Ren, Xiaoyu Ren, Jun He, Lin Tao, Douglas A. Passey, Jian Wang, Huangming Yang, Jun Yu, and Songgang Li. RePS: A sequence assembler that masks exact repeats identified from the shotgun data. Genome Research. 12:824-831, 2002.
Qiyu Bao, Yuqing Tian, Wei Li, Zuyuan Xu, Zhenyu Xuan, Songnian Hu, Wei Dong, Jian Yang, Yanjiong Chen, Yanfen Xue, Yi Xu, Xiaoqin Lai, Li Huang, Xiuzhu Dong, Yanhe Ma, Lunjiang Ling, Huarong Tan, Runsheng Chen, Jian Wang, Jun Yu, and Huanming Yang. A Complete Sequence of the T. tengcongensis Genome. Genome Research. 12:689-700, 2002.
International Human Genome Sequencing Consortium (Beijing Genomics Institute, Yang as the Coordinator-in-China). Initial sequencing and analysis of the human genome. Nature, 409: 860-921, 2001.
Jun Yu, Songnian Hu, Jun Wang,….. Lihuang Zhu, Longping Yuan, Huanming Yang. A draft sequence of the rice (Oryza sativa ssp. indica) genome. Chinese Science Bulletin, 46:1937-1942, 2001.