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利用寡核苷酸延伸法进行纯化DNA片段的放射性标记

   随机引物法:利用寡核苷酸延伸法进行纯化DNA片段的放射性标记

1.      在一个0.5ml的微量离心管中加入溶于30μl水的模板DNA(25ng)1μl随机脱氧核苷酸引物(约125ng)。盖紧微量离心管,置于沸水浴中2min

2.      将微量离心管移至冰上放置1min4℃下离心10s使引物与模板的混合物沉降至管底,将微量离心管重新置于冰上。

3.      在引物与模板的混合物中加入:

5 mmol/L dNTP溶液          1μl

5×随机引物缓冲液          10μl

10 mCi/ml [α-32P] dNTP      5μl

(比活性3000 Ci/mmol  

                         加至50μl

 

5×随机引物缓冲液:

250 mmol/L Tris (pH8.0)

25 mmol/L MgCl2

100 mmol/L NaCl

10 mmol/L 二硫苏糖醇(DTT

1 mol/L HEPES(4mol/L NaOH调至pH6.6)

1 mol/L DTT贮存于-20℃,临用前用水稀释,使用后弃去稀释的DTT

4.      加入5单位(约1μl)的Klenow片段,轻弹管壁以混合各组分。以最大速度离心12s使所有液体沉降到管底。反应混合物室温下反应60min

5.      在反应液中加入10μl NA终止/贮存缓冲液,可根据需要进行以下步骤。

NA终止/贮存缓冲液:

50 mmol/L Tris-Cl(pH7.5)

50 mmol/L NaCl

5 mmol/L EDTA(pH8.0)

0.5% (m/V) SDS

贮存放射性标记的探针于-20℃以备杂交用。

通过离心柱层析分离放射性标记的探针与未结合的dNTP或以乙酸铵和乙醇选择性地沉淀放射性标记的DNA。如果>50%的放射性dNTP已在反应中掺入,可不进行该步骤。

 

另法

11.5ml微量离心管内依次加入:

10200ng模板DNA(溶于19μl水)

灭菌双蒸水加至9μl

2.离心管加热至100 5min即置入冰浴,短暂离心。

3.冰浴上依次加入:

2μl 10×反应缓冲液

1μl 0.5 mmol/L dATP(终浓度25μmol/L

1μl 0.5 mmol/L dGTP(终浓度25μmol/L

1μl 0.5 mmol/L dTTP(终浓度25μmol/L

5μl α-[32P] dCTP(终浓度0.83μmol/L

1μl大肠杆菌DNA聚合酶I Klenow大片段(2U

437℃温育30min

5.当温育反应物时,同时制备Sephadex G-50自旋转,2000×g离心2 min

6.加入2μl 0.2mol/L EDTApH8.0)终止反应。反应混合液装样至自旋柱,2000×g离心4min

7.取1μl柱洗脱液用液闪仪计数。用于杂交实验前,应将探针加热至100 5min使之变性,随即置入冰浴5min

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