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北京生命科学研究所招生简章

2004-11-23 0:25:00 信息来源: 本站原创 
  •   北京生命科学研究所招生简章

一、北京生命科学研究所简介(http://www.nibs.ac.cn

北京生命科学研究所是为了促进中国生命科学发展而建立的,其任务是进行基础研究,同时培养优秀科研人才,探索新的、与国际接轨、而又适合中国发展的科研运作机制。英文名称是National Institute of Biological Sciences, Beijing”(简写为:NIBS, Beijing

北京生命科学研究所一切工作以推动一流科学研究为目的。中心工作是使主要科研人员能进行原创性的研究,推进人类对生命本质的理解,同时也鼓励研究人员发现和发明对于中国和世界有应用价值的工作。为了实现这个目的,研究所将:实行高效率的管理,以科研人员为主导,行政后勤人员为辅助使所内研究工作顺利开展;提供优良的物质条件,使研究人员能全力注重科学研究;建立有智力刺激而又心情宽松的精神环境,使研究人员能有创造性思维,进行优美和有意义的研究,做出重要的和根本的发现。

北京生命科学研究所要求从学生到教授等所有研究人员在科学研究和讨论中互相尊重、互相激励,鼓励其所有人员和国内外大学和其它研究机构进行积极的科学交流和互利合作,并欢迎国内外生命科学研究人员访问、交流。定期举办的Journal ClubSeminar等多种形式的学术交流活动,为北京生命科学研究所营造了健康活跃的学术氛围。主要研究人员同时兼职于北京高校和科研机构,乐于为中国其他机构提供力所能及的教学和科研咨询。

崭新的北京生命科学研究所位于风景宜人的北京市郊北京中关村生命科学园。北京生命科学研究所主要依托于北京市政府和国家科技部,并得到国家发改委、教育部、中国科学院等8个部委的大力支持。研究所依法登记成立,具有事业法人资格,独立承担民事责任。本所已诚聘多位研究室主任和研究员,有望在2005年达到20个实验室。

二、研究所PI的研究概述:(http://www.nibs.ac.cn/index1.php?act=view&id=21

王晓东实验室:

我们的研究目标是在分子水平上理解细胞凋亡----一种细胞内固有的自身消亡的生化过程。同时,我们还希望在人类疾病如癌症中精确地找到这一基础生化过程的缺陷,并根据我们从研究中获得的信息来设计相应的治疗策略。

我们在研究中运用了多种实验方法,涵盖了生物化学、分子生物学、细胞生物学的最新技术。同时,我们和其他的实验室也有非常活跃的合作,合作领域涉及线虫、小鼠等模式系统的遗传学,包括X-射线结晶学、电子显微镜的结构生物学,以及高通量筛选化合物库及化学合成的化学生物学。我们计划在NIBS建立这些技术并使这些技术能为所有NIBS的实验室利用。
   
NIBS实验室将继续研究细胞凋亡的生化途径。同时,我们将研究RNA干扰(RNAi)的生化机制及其在哺乳动物系统中的生物学功能。

邓兴旺实验室:

我们的研究兴趣主要在细胞外刺激引起的细胞信号传递过程及其对机体发育的调节。主要集中在两方面:光调控的拟南芥幼苗的发育过程以及其在哺乳动物中普遍保守的一种细胞信号传递途径。我们在研究光信号对拟南芥发育调节的信号通路时,找到了10个多效性COP/DET/FUS位点,确定它们介导了光对拟南芥幼苗发育过程的调节。其中,COP1是拟南芥光形态建成的关键的抑制因子,在暗中在细胞核内作为E3通过26S蛋白体降解促进光形态建成的转录因子,而在光下COP1活性被抑制且在核内的丰度降低;另外一个基因COP10编码一个类似E2的蛋白,并以多亚基蛋白复合体存在。其余的多数基因编码一个高度保守的多亚基蛋白COP9复合体(COP9 signalosome)的不同亚基,COP9复合体是一个新的E3连接酶的调节因子,可以促进NEDD8/RUB1从特定的E3连接酶上解离下来。COP9复合体是细胞对外界刺激或胁迫产生反应的新的调节成分。目前,我们正在采用分子遗传和基因组学的方法,进一步深入地研究我们发现的在所有多细胞有机体中都保守的细胞调节蛋白及复合体的功能。我们希望了解胞外信号调节这些蛋白及复合体的信号转导机制,以及在环境刺激发生反应时这些蛋白及复合体对基因组表达模式的调节。

 

饶毅实验室:

我们主要兴趣在于两个相关而有不同的基本生物学过程:
1)
神经细胞的极性(polarity) 2)细胞发育的分子机理

为了研究这些神经生物学和发言生物学问题,我们使用多学科的综合途径, 主要包括分子生物学, 现代成像,遗传学,和生物化学,极性是神经细胞的一个基本性质。我们研究神经细胞在形态发生过程中极性形成的机理(polarity in orphogenesis)和神经细胞迁移过程中的极性(polarity in migration)。神经细胞在形态上有轴突(axons)和树突(dendrites),它们有不同的作用,树突多半接受信号,而轴突通常发送信号。如果没有神经细胞的极性,神经系统的信息传递就会紊乱。我们在分子和亚细胞水平研究神经细胞轴突和树突极性发生的机理。除了可以帮助基础理解以外,如果能知道怎样形成轴突,也许可以提示如何在损伤后帮助促进神经纤维再生。
   
极性在神经发育中还有一个重要作用在于神经细胞的迁移过程中。我们希望理解神经细胞迁移在空间和时间上的控制机理。包括:细胞和细胞间相互作用,细胞外分泌性信号(通常是蛋白质),细胞内信号转导通路和细胞运动基本机器(通常认为是细胞骨架的调控)。我们已经知道一些细胞可以通过分泌导向性的蛋白质来控制其它细胞的迁移方向。这些细胞外信号使细胞内分子的活性有极性分布,从而导致细胞进行有极性的运动。我们传统是用分子生物学来进行这些研究,但最近还建立生物物理学的方法(现代成像技术)来实时观察运动的细胞内部分子活性。希望基础研究的结果和具体的分子也许有助于改善脑瘤控制上。
   
我们对动物发育机理中细胞命运有兴趣。我们希望对干细胞,特别是全能干细胞有比较根本的理解。我们和王晓东实验室合作,用生物化学手段研究干细胞转化过程的分子基础。我们对用特种神经元形成的分子机理也感兴趣,希望以遗传和生化手段进行研究。

 

徐燕实验室:

我们主要的兴趣是研究卵巢癌,乳腺癌,前列腺癌和其他恶性肿瘤发生,发展的分子机制。包括发现这些癌症的有效的诊断生物标记和预后的生物标记,确定新的治疗靶标,发展先的治疗方法。我们率先在卵巢癌中研究了信号脂类分子的作用,已经鉴定了第一个脂类生长因子--溶血磷脂酸(lysophosphatidic acid LPA),发现LPA参与了卵巢肿瘤细胞的增殖,生存,迁移,侵袭,和转移。另外,我们还证明了LPA是一个可以用于卵巢癌早期发现的潜在的标记物。我们发展了一种高效的方法,可以来分析体液中的溶血磷脂。用这种方法我们发现,在卵巢癌病人的血液,腹水,腹膜洗液中,一些特定的有生物活性的溶血磷脂的含量升高了。当前,我们已经把这种研究扩展到乳腺癌,前列腺癌,结肠癌。我们研究了LPA以及与其相关的一些脂类信号分子比如S1P(sphingosine-1-phospahe), SPC(sphingosylphosphorylcholine), LPC(lysophosphatidylcholine)在肿瘤细胞中的作用和信号传导的机制,希望能为癌症的治疗鉴定出新的治疗靶点。我们的研究用了生物化学,分子生物学,肿瘤生物学,分析生物化学,细胞生物学遗传学等领域中的各种技术。当前,我们同时进行体外(细胞培养)和体内(小鼠模型)的研究。我们已经发现了两个脂类分子,SPCLPC的受体。溶血磷脂和其他小的生物活性分子可以通过G蛋白偶连受体(GPCR)起作用。越来越多的证据表明,很多疾病,比如癌症,与GPCR的结构与功能的异常有关。

克隆和鉴定新的GPCR将有助于我们更好的理解这些受体的正常功能和信号传导机制,以及它们在癌症中的作用。GPCRs蕴涵着药物发现的重大希望。现在50%的药物都是以GPCR为靶标的。我们已经鉴定了三种GPCROGR1, GPR4G2A,它们是SPC或者LPC的受体。血管发生对于许多生理和病理过程是非常关键的。我们最近发现SPC能够在体内诱导血管的发生。SPC的高亲和性受体GPR4对于SPC在内皮细胞中起作用是必需的。在人脐静脉内皮细胞中,GPR4的下调,特异性得抑制SPC(不是S1P, 或者血管内皮生长因子)诱导的血管生成。而重新导入GPR4基因,又可以完全恢复SPC的活性。通过SPC依赖或者SPC不依赖的途径,GPR4在微血管内皮细胞的存活,生长,迁移和血管的形成中,发挥了重要的作用。SPC/GPR4的相互作用激活了phosphatidylinositol-3激酶和AktSPC在内皮细胞中发挥作用需要SPC诱导的转磷酸化激活VEGF受体2。这些结果确定了SPC及其受体,GPR4是内皮细胞血管发生的关键调节因子。最近,我们发现OGR1在肿瘤转移中起了重要作用。信号脂类分子领域是一个新兴令人兴奋的领域。我们已经做了一些开拓性的工作,把这些脂类分子跟卵巢癌和其它癌症联系起来。我们将继续在这一领域做一些前沿的研究工作,已期能够更好得了解肿瘤的发生,并能够提供新的诊断和预后的临床工具,治疗靶点和试剂

赵光泉实验室:

多能性胚胎干细胞具有分化为体内各种细胞包括原始生殖细胞(PGC)(所有配子的祖细胞)的能力。由于PGCs能在体外培养时形成与胚胎干细胞类似的细胞而也被认为是多能性干细胞。因此,生殖细胞和多能性具有密切的联系。我们的研究兴趣是干细胞生物学。

1. 研究BMPs在保持胚胎干细胞多能性中的作用机制:我们已证明BMP4通过ALK3受体的信号传导抑制MAPKs来保持小鼠胚胎干细胞多能性。为了理解BMPs在保持多能性中如何起作用,我们正在通过酵母双杂交系统筛选和共免疫沉淀方法来发现胚胎干细胞中与ALK3反应的蛋白质。

2. 研究原始生殖细胞(PGC)的形成机制:虽然我们已经证明BMP4BMP8B的协同作用是PGC形成所必须的,但在早期胚胎发生中PGC形成的分子机制还远未研究清楚。我们正在研究BMP途径和其他途径是如何配合而导致胚胎干细胞发育为原始生殖细胞。

3. 已分化细胞重编程为多能性干细胞的研究:多能性细胞在组织和细胞治疗中具有巨大的潜能。已有试验证明胚胎干细胞的胞浆中存在能使已分化的体细胞重编程为多能状态的因子。如果我们能够利用不同因子的组合将皮肤或血细胞转变为胚胎干细胞,对人类的利益无疑是巨大的。这是我们的长远目标之一。

4. 研究精原干细胞(SSCs)的自我更新:在男性,PGCs在胚胎发育过程中进入生殖腺发育成原精原细胞,并在出生后发育成精原干细胞。精原干细胞具有自我更新及产生分化的精原细胞并最终形成成熟精子的能力。我们的目标是研究生长因子介导的信号传导途径如何控制在生殖健康和节育中有重要影响的精原干细胞的自我更新。

 

周俭民实验室:

植物可以感受病原菌的入侵,并且启动防卫反应成功地抵御病原菌的感染。同样,病原菌能够感受植物寄主来激活毒性机制感染寄主,引发病害。

本实验室将致力于植物与微生物间相互作用机理的研究。我们主要以拟南芥和假单孢杆菌间互作为模式体系进行下述方面的研究,来阐述植物病理学中的一些基本问题。

非寄主抗性的研究 此项研究旨在了解非寄主抗性和植物与病原体对寄主的特异性问题。非寄主抗性是对任何植物物种对绝大多数潜在病原菌都具有抗性这一现象的描述。

我们首次建立了研究植物非寄主抗性的遗传模型。我们的研究结果表明,植物对非寄主病原体的免疫至少部分归功于主动防卫反应。我们已经分离得到了几种对P. s. pv. phaseolicola非寄主抗性有所降低的拟南芥突变系(nho),并分离到了NHO1基因。发现NHO1基因参与至少四个抗性基因的功能。我们推测可能是假单孢菌共有的病原相关分子特征(PAMPs)诱导了NHO1基因的表达。

调节致病菌基因表达的寄主信号 为了进一步了解植物抗病反应中植物来源信号的本质,我们利用遗传学方法在拟南芥中鉴定了一个影响致病菌毒性基因表达的遗传位点。拟南芥中遗传位点ATT1能够抑制细菌三型分泌系统基因的表达。ATT1克隆和对att1突变体进一步鉴定暗示植物细胞外的脂质对抑制细菌三型分泌系统基因的表达和抗病性起一定作用。下一步我们会继续筛选更多的拟南芥突变体,并利用生化方法确定影响细菌三型分泌系统基因表达的各种寄主因子。这些研究会让我们更深刻地了解细菌所感受到的寄主信号。

 

郭岩实验室:

我们实验室的研究兴趣主要是植物如何感受并响应环境胁迫,诸如土壤高浓度盐、碱,及干旱。特别是植物在胁迫条件下体内Ca2+信号和pH内平衡的调节。

主要研究内容是利用拟南芥突变体研究植物感受环境胁迫信号过程中所发生的遗传和分子特性的变化。目的是为了阐明植物响应环境胁迫的信号路径,并鉴定一些具有潜在功能的能够提高作物适应环境胁迫的关键作用元件。

 

柴继杰实验室:

本实验室关注并研究在生物学及药学应用中的重要大分子的结构与功能。主要通过蛋白晶体衍射的方法及一些生物、生化方面的手段阐述这些生物大分子在结构和功能上的联系。我们并不局限于已建立的研究框架,拟与北京生命科学研究所的其他研究小组合作,在今后的工作中开展一些联合研究项目。

一个正进行的研究方向将关注专职吞噬细胞(professional phagocytes)对调亡细胞的识别途径。近十年来大量的工作已对调亡调控的机制做了详尽的研究。相对的,在细胞调亡后如何去除调亡的细胞残体的问题并没得到关注。(此问题并不是不重要)如果在此环节出现问题将造成炎症反应的异常持续和自身免疫的出现。在吞噬细胞消除调亡的细胞体的过程中,第一步反应是调亡的细胞体和处于调亡过程中的细胞表面出现如磷脂酰丝氨酸(PS)等可被各种吞噬细胞上的受体识别的发出“eat-me”信号的信号分子。近年来的研究发现这一识别过程并不仅仅是此类信号分子与吞噬细胞受体的简单结合。实际上,一类可被其他吞噬细胞的受体识别的桥联分子(bridging molecule)如Annexin IAnx I)也参与了识别过程。除此,我们还将对“don’t-eat-me”信号的识别机制及溶血磷脂酰胆碱(LPC)等“find-me”信号的产生和调控机制进行研究。前者存于正常细胞,保证这些非调亡的细胞不被错误吞噬;后者为调亡细胞所产生。

本实验室的另一个研究目标是吞噬细胞识别和吞噬调亡细胞的信号调控的分子机制。前人在线虫(C. elegans)的遗传学筛选工作中发现七个基因产物分别隶属于两条功能上冗余的信号转导系统参与了清除调亡细胞体过程。其中一条信号系统为CED-2/ced-5/CED-12/CED10,这条信号系统保守的存于哺乳类中,其同源信号系统为CrkII/Dock180/ELMO/RAC,我门将从蛋白三维结构的尺度研究这条信号系统的活化和调控机制。

王海洋实验室:

本实验室的研究方向主要是运用拟南芥作为模式系统来探索植物光敏素A信号传导以及植物光形态建成的分子生物学、细胞学、和生物化学机制。

光是植物生长发育的主要环境影响因素之一,而且是作物产量的重要决定因子。植物几乎能够感受各种层次的光,包括光照方向、光照持续时间、光量度以及光的波长。而感受这些光主要是通过三种光受体,分别为隐花色素受体、向光色素受体和光敏色素受体。隐花色素和向光色素受体吸收的是蓝光和紫外光A区域的光线,而光敏色素主要吸收的是红光和远红光波长的光。在这些光受体中,对光敏色素受体的作用特点研究的最为清楚。在拟南芥中有五种不同的光敏色素,分别被命名为phyAphyE。这些光敏色素受体在不同的光形态建成反应中所起的作用有时是不同的,有时有部分的冗余甚至相反的作用。PHYBPHYE的基因表达产物主要是在连续的红光和白光的光照条件下调控各种光反应。PhyA主要在各种远红外光调控的反应中起作用。

本实验室主要寻找和研究一些参与phyA信号传导的中介基因。目的是为了阐明光敏色素A接受信息并且把信息传递到靶基因的生化和细胞学机制,从而了解光是怎样调节基因表达进而导致了光形态建成。

 

张宏实验室:

我们工作的兴趣主要集中在研究PcG (Polycomb group)基因介导的表型基因沉默机理。众所周知,PcG蛋白可以维持关键的发育调节因子如Hox基因的准确表达模式。而且,现在越来越多的证据现实,PcG蛋白也参与了对细胞增殖和肿瘤发生的调节过程。然而,在果蝇和哺乳动物细胞中,PcG复合体的成分非常复杂。这就阻碍了我们对PcG介导基因沉默以及相关靶基因的研究。与此相反,在秀丽线虫(C.elegans)中,PcG复合体的成分相对简单。我们的工作就是利用秀丽线虫作为模式系统研究PcG复合体介导的基因调节作用并从而延伸到对哺乳动物的研究。

前期工作已经证明秀丽线虫的PcG蛋白SOP-2蛋白具有RNA结合能力。在功能和结构上,这都与其他机体的PHSCM蛋白类似。 有意思的是,SOP-2蛋白可以形成明显的核小体即SOP-2小体。SOP-2小体的形成和其功能紧密相联,并可被翻译后修饰如sumoylation调节。

因此,本实验室以后的工作主要集中在:

1. 鉴定SOP-2蛋白结合的RNA成分,并阐述其在SOP-2介导基因沉默中的作用。PHSCM结合RNA的活性以及在基因沉默中的作用也将被进一步的研究。

2. 研究核小体在SOP-2介导基因沉默中的作用。进一步鉴定SOP-2核小体的成分并分析SOP-2小体形成的调节途径。

3. 鉴定SOP-2靶基因并研究在SOP-2突变体中看到的它们对发育过程的多方面调节效应。

三、北京生命科学研究所2005年招生

注:均为五年制硕博连读生

1.招生要求:

1)       符合中国协和医科大学或中国农业大学或北京师范大学2005年招生简章所要求的报名条件者(包括推荐免试生),报名时请注明北京生命科学研究所,以保证报名材料转到研究所;

推荐免试生    请按照各联合招生单位关于接收推荐免试生的要求报名、寄送材料,由研究所负责复试、录取事宜。

注:  1. 北京生命科学研究所和中国协和医科大学2005年联合招收的10名五年制直博生均为推荐免试生;

2. 北京生命科学研究所和北京师范大学2005年联合招收的10名五年制直博生(推荐免试生)均为北京师范大学2005年应届本科毕业生。

3. 北京生命科学研究所和中国农业大学2005年联合招收的2名五年制直博生(推荐免试生)均为中国农业大学2005年应届本科毕业生。

非推荐免试生按照正常的报名、考试程序参加中国农业大学的研究生考试,由北京生命科学研究所负责复试、录取事宜。

2)        具备申请美国高等院校及科研机构博士生条件者,请将申请材料及TOEFLGRE成绩证明一并邮寄或电子邮件至研究所,我们将根据申请人的申请材料,进行素质审核(侧重审核申请人的毕业学校与专业、品德、学术水平及其在所报专业领域内的发展潜力)。申请材料内容:

A.      Personal statement

B.      本科/硕士研究生成绩单

C.      23封推荐信

2.  考生报名时间:2004911031

3.  报名费请通过网上报名系统交至联合招生学校的研招办。

4.   提交的申请材料请分别按照联合招生学校网上招生简章所要求的时间和内容,一式两份向北京生命科学研究所和各联合招生学校的研招办寄(送)申请资料。

四、招生专业目录

     

指导

教师

  

分子生物学

Apoptosis, RNAi

王晓东

五年制硕-博连读生

分子生物学

Plant Development and Signaling

邓兴旺

五年制硕-博连读生

分子生物学

Neuroscience

 

五年制硕-博连读生

分子生物学

Cancer Biology

 

五年制硕-博连读生

分子生物学

Stem Cell Biology

赵光泉

五年制硕-博连读生

分子生物学

Plant-Microbe Interactions

周俭民

五年制硕-博连读生

分子生物学

Abiotic Stress

 

五年制硕-博连读生

结构分子生物学

Apoptotic Body Clearance

柴继杰

五年制硕-博连读生

分子生物学

Plant Developmental Biology

王海洋

五年制硕-博连读生

分子生物学

Epigentic Gene Silencing

 

五年制硕-博连读生

五、联系方式:

北京市中关村生命科学园  科学园路7  北京生命科学研究所 李学真

Tel010-80726688-8807

E-maillixuezhen@nibs.ac.cn

六、备注:

录取学生进入研究所后,自选23个实验室训练后(每个实验室2个月),自选研究方向和导师。

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