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中国学者最早发现两新型耐药基因正式“问世”

2007-11-13 14:49:10 信息来源: 生物谷(www.bioon.com) 
  •   中国学者最早发现两新型耐药基因正式“问世”

深圳市第二人民医院检验科副主任徐小平历时三年研究,发现的两个与细菌耐药有关的新型OXA基因传来好消息。世界基因库(DDBJ/EM-BL/GenBank))已正式把这两个基因命名为OXA-116OXA-117。医学界人士指出,世界耐药基因数据库增添的这两名新成员,有利于进一步监测耐药菌株、指导临床合理用药、减少耐药菌产生和传播,同时研究抗生素的耐药机制及基因环境开辟了新的道路。

 

人物小档案

徐小平 检验科副主任检验师

医学硕士,科副主任、临床检验诊断学教研室副主任,深圳市检验专业委员会委员,深圳市微生态专业委员会委员,《中国医学检验杂志》编委,《中华检验医学杂志》编审专家。一直从事临床检验工作,主要是从分子水平研究与人类感染性疾病相关的病原微生物快速诊断方法、病原微生物遗传变异和耐药机制、病原微生物致病基因及机制。现主持广东省科技计划项目及深圳市科技计划项目各一项,完成科研项目5项,获实用新型专利1项,在省级以上刊物发表论著近30篇。

 

世界基因库

Genbank库包含了所有已知的核酸序列和蛋白质序列,以及与它们相关的文献著作和生物学注释。它是由美国国立生物技术信息中心(NCBI)建立和维护的。它的数据直接来源于测序工作者提交的序列;由测序中心提交的大量EST序列和其它测序数据;以及与其它数据机构协作交换数据而来。Genbank每天都会与欧洲分子生物学实验室(EMBL)的数据库,和日本的DNA数据库(DDBJ)交换数据,使这三个数据库的数据同步。到19998月,Genbank中收集的序列数量达到460万条,34亿个碱基,而且数据增长的速度还在不断加快。Genbank的数据可以从NCBIFTP服务器上免费下载完整的库,或下载积累的新数据。NCBI还提供广泛的数据查询、序列相似性搜索以及其它分析服务,用户可以从NCBI的主页上找到这些服务。

Genbank库里的数据按来源于约55,000个物种,其中56%是人类的基因组序列(所有序列中的34%是人类的EST序列)。每条Genbank数据记录包含了对序列的简要描述,它的科学命名,物种分类名称,参考文献,序列特征表,以及序列本身。序列特征表里包含对序列生物学特征注释如:编码区、转录单元、重复区域、突变位点或修饰位点等。所有数据记录被划分在若干个文件里,如细菌类、病毒类、灵长类、啮齿类,以及EST数据、基因组测序数据、大规模基因组序列数据等16类,其中EST数据等又被各自分成若干个文件。

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