来源
2006-6-16 13:04:26

Nature:单细胞层次上的蛋白组学研究

        一个活细胞产生数以千计的不同蛋白,调控这些蛋白的含量是细胞生物功能的关键。每种蛋白都只能以很少的数量产生,所以要对它们分别进行测定在技术上是困难的。但研究人员采用了一种新的策略,他们利用高通过量的流式细胞计量方法和荧光标记方法,来以单细胞分辨率对酵母中25000种以上的蛋白的含量进行监测。利用DNA微阵列方法也可以观察一个细胞对环境变化的反应,而该方法是从另一个角度来研究同一个问题。分析结果表明,不同蛋白的“噪音”水平部分取决于它们的功能。从事至关重要的“家务工作”的蛋白在不同细胞之间往往是统一的,但参与环境响应的蛋白则在不同细胞之间是不同的。影响噪音水平的其他因素包括一个蛋白在细胞内的位置及控制其产生的机制。

原文出处:
Single-cell proteomic analysis of S. cerevisiae reveals the architecture of biological noise p840

John R. S. Newman, Sina Ghaemmaghami, Jan Ihmels, David K. Breslow, Matthew Noble, Joseph L. DeRisi and Jonathan S. Weissman

doi:10.1038/nature04785

 

蛋白质组学工作流程

RotoforTM cell制备电泳槽

Model 491 Prep cell 制备电泳槽

BioLogicTM Chromatography Systems层析系统

ReadyPrepTM Sequential Extraction 样品顺序抽提试剂

蛋白染料
Bio-SafeTM  Coomassie Stain

Silver Stain Plus Kit
SYPRO Ruby Fluorescent Gel Stain

PDQuestTM 二维电泳图像分析软件

Quantity ONE一维电泳图像分析软件

M@LDI Q-Tof质谱

WorksBase大型数据库生物信息平台

样品制备

制备型电泳和层析可用于浓缩蛋白样。

顺序抽提试剂可根据蛋白溶解度分离蛋白

层析系统可用于低丰度蛋白收集

双向电泳

第一向等电聚焦:高通量易操作的等电聚焦仪及多种规格的预制胶条保证实验的高分辨率和重复性。

第二向SDS-PAGE,  三种尺寸,小规模及高通量电泳槽满足用户的不同需要。

染色

荧光染料,考马斯兰染料,银染各种染料

成像

各种规格图像仪满足光密度扫描、荧光,化学荧光,化学发光,同位素成像等不同需要

分析软件

功能强大的一维电泳和二维电泳分析软件,图像获取,图像优化,比较分析,数据库,控制Spot cutter, 质谱数据连接均通过一个软件进行。

蛋白切取工作站和酶解

蛋白点鉴定

WorksBase生物信息处理平台

ProteomeWorksTM Spot Cutter with Fluorescent
Spot Cutter
蛋白点切取工作站

MassPREP station

GS-800TM 光密度扫描仪

FX分子成像系列

第一向

PROTEAN IEF Cell 等电聚焦电泳仪

ReadyPrepTM  IPG strips

第二向各类电泳槽

Mini-PROTEAN 3, Mini-PROTEAN 3 Dodeca Cell

Criterion Cell, Criterion Dodeca Cell

PROTEAN IIXL Cell, PROTEAN Plus Dodeca Cell

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

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