生物谷报道：来自芝加哥大学生态进化与人类遗传学系，中国国家人类基因组上海研究中心（Chinese National Human Genome Center at Shanghai,CHGC），芬兰哥本哈根大学（University of Copenhagen），上海交通大学瑞金医院上海血液学研究所，中山大学进化与基因组研究国际中心（International Center for Evolutionary and Genomic Studies）的研究人员通过对黑腹果蝇（Drosophila melanogaster）等几种相近的果蝇进行419个基因测序，从基因组水平探讨了适应性进化（adaptive evolution），并进一步在此水平上讨论了相关理论和数据。这一研究成果公布在《美国国家科学院院刊》（PNAS）网络版上。
这一研究的通讯作者的来自上海交通大学瑞金医院的陈竺教授，以及中山大学长江学者吴仲义教授。
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Published online before print February 6, 2007
Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 10.1073/pnas.0610385104
Adaptive genic evolution in the Drosophila genomes [Abstract]
生物进化是指生物种群多样性和适应性的变化，或一个群体长期的遗传组成上的变化。其中的核心就是适应进化机制和选择作用（selection），其中适应性进化（adaptive evolution）即指生物在分支发展过程中，局部结构和功能发生了变化，以适应特殊的环境，比如说为什么不同物种存在于各自特定的区域？这就是一个涉及到区域性或全球性的生物适应问题。
黑腹果蝇（Drosophila melanogaster）是一种小型蝇类，喜在腐烂水果及发酵物附近飞舞。它的特点是生活周期短（约15天），突变性状多，唾腺染色体大且有特定的横纹，加上容易在室内饲养，所以是进行遗传学实验研究的好材料。摩尔根等人就是从研究黑腹果蝇中发现了“伴性遗传”、“连锁与互换”等现象和规律，从而发展了染色体遗传学说的。
以黑腹果蝇以及其进化上相近的果蝇种类为研究对象，研究人员针对基因水平上适应性进化的宽度展开了研究。通过对24系419个基因进行测序，他们发现：
i)正常重组区域中大约10%的位点比预期的沉默位点多态性少得多，这说明有selective sweeps；
(ii)多态性水平与非同义分歧（nonsynonymous divergence）成负相关关系，因此即使在严格的
(iii)观察得到的物种（419个locus）之间A/S比率是28.9%，这比neutral expectation高；
(iv)这种适应性进化的信号只有在正常重组区域才可以观察到。
从这些得到的研究数据中，研究人员在基因组水平上探讨了适应性进化解释的相关理论和数据，为进一步了解适应性进化提供了重要资料。
附：
陈 竺
陈竺，中国科学院副院长，中国科学院院士，美国科学院外籍院士，欧洲艺术、科学和人文学院院士，第三世界科学院院士，上海第二医科大学教授，上海第二医科大学附属瑞金医院终身教授。
1953年生于上海，1981年获上海第二医科大学硕士学位，1989年获法国巴黎第七大学博士学位。现任中国科学院副院长，国际科学院协作组织主席，上海血液学研究所所长，国家人类基因组南方研究中心主任，国务院学位委员会委员，中国科协常务委员，上海市科协副主席，中华医学会遗传学会副主任委员，中国遗传学会人类遗传学专业委员会主任委员，国家“973”计划首席科学家，国家“863”计划生物与现代农业技术领域专家咨询委员会主任，意大利热那亚大学名誉教授，国际血友病联盟成员，国际人类基因组组织（HUGO）顾问委员会成员。
