http://www.bioon.com 生 物 谷 网 站    100万美元重奖能够研制出“10天内完成100个人类基因组样本测序任务（覆盖率不小于98％，误差不大于1/10，000bp）”设备的第一支研究小组！当10月4日X大奖基金会（X  Prize  Foundation）宣布此项为基因组学设立的Archon  X  Prize时，即让人兴奋，又让人怀疑。

　　“这是无论如何也完不成的，”麻省理工学院和哈佛大学的Broad研究院（Broad  Institute  of  MIT  and  Harvard）基因组测序和分析项目主任Chad  Nusbaum说，“我们已经可以对一个基因组进行测序了，但是这些离这个要求还太遥远。”哈佛大学医学院遗传学教授George  Church说人类基因组计划的覆盖率只有93％，出错率为1/10，000bp。Nusbaum补充说，人类基因组测序样本并不是来自于一个个体，“是几个个体来源的单模标本的拼接。”

《The  Scientist》杂志专栏作者Jeffrey  M.  Perkel就此争论，给我们做了市场分析。

　　Perkel说：“我想知道的是，现在是谁在进行这种唐·吉呵德形式的quixotic  X  Prize”。几个被看好的竞争者：454  Life  Sciences、Solexa、Helicos  BioSciences、VisiGen  Biotechnologies、Applied  Biosystems和  Church中，454  Life  Sciences和VisiGen  Biotechnologies已经注测。

　　其它公司无角逐之意

　　新一代游戏玩家Applied  Biosystems，当其在今年年初获得Agencourt  Personal  Genomics（与Church有联系）后，该公司高通量分析研发项目主任Gina  Costa说公司决定放弃，不再打算将DNA测序技术商业化。Church也不会，其主打是个人基因组计划（Personal  Genome  Project），目标是完成个体样本1％的基因组测序（今年完成10个样本，尽快实现数百万样本）。当然，Church也表示，“假如某天我们突然说我们可以轻松摘得100万美元，相信也不会有人晕倒。”

　　Solexa副总裁和首席科技官Tony  Smith绝句透漏其公司是否有意角逐。Helicos市场部高级副主席Steve  Lombardi说他们还没有做最后决定。

　　几个公司最终的目的都是提高测序速度、降低测序成本。目标相同，利益类似是他们进入角逐比赛的动力  。VisiGen会长Susan  Hardin说“X  Prize与VisiGen的使命一致。”同样，454会长、CEO  Chris  McLeod说：“我们早已下定决心寻找快速、经济的测序全基因组的方法，我们参与竞争很正常。”

　　功能已知并且可以检测的遗传变异有几百个，但是其中只有一小部分有临床实践意义，比如syndromic  loci和原癌基因。检测这些位点，我们不需要对全基因组进行测序，甚至真的不必研发下一代测序技术，除非是为了提高分析速度。假如我们真的能够将每种健康问题或者易患病体质都与我们的25，000或蛋白编码和调节RNA基因联系起来，也只能代表不到2％的人类基因组。

　　尽管目前我们对基因组的了解还很少，但公司角逐测序全基因组的动力是什么？Perkel  说：“我推测的几条原因，从弄清人类变化到改善癌症诊治。”大多数的观点是：尽管今天我们还用不到这些数据，我们收集的测序信息越多，后继实验所发现的问题也就越多。Hardin说：“全基因组测序的价值会随着比对的基因组数量的上升，日益凸显。”

　　另一个问题是：为什么将目标定的这么高？X  Prize基金会公共关系主任Ian  Murphy说：“关键是根本性的突破，除非我们有能力获得上百个基因组图谱，在几个小时内获得上百个基因组图谱，而不是几天、几个月、几年，我们是不可能使这种技术得到全面发挥的……我们不想增加目标，只是想改变我们的生活方式。” http://www.bioon.com 生物谷网站