在神舟五号飞船之前，我国已经进行了四次神舟飞船的成功发射，并在飞船上搭载了一些科学实验。在神舟三号和四号飞船上，我国科学家曾经连续两次做了太空育种实验。通过实验发现：太空环境不仅可以使搭载植物在生长速度和外观上发生变化，而且部分植物的基因排序发生了改变。
在地面选育过程中，科学家们注意到，树梅等一些经过神舟飞船搭载的植物种子在长成植株后，外观和性状上都发生较大的变化。
同样是树梅，为什么经过一次太空旅行就会发生这样明显的变化呢？科学家们在选育的同时，也从生物分子学角度做了机理研究。他们分别提取了经过太空搭载的和地面上的两种树梅基因，经过电泳扩增、染色后，进行对比。实验结果显示，太空环境可以使树梅的基因排序发生改变。
通过实验，科学家们确认太空搭载导致树梅的基因排序发生变化，下一步科学家们还希望发现树梅基因排序与性状变化之间的联系，最终找出影响性状变化的基因，弄清楚太空环境究竟给植物生长带来怎样的影响。科学家们还发现番茄、月季等其他一些植物的基因排序上也发生了相似的变化。
科学家同时指出，尽管太空搭载可以改变植物的基因排序，但是太空育种绝对不是转基因育种。
