来源
2005-9-21 3:18:45

PNAS:中国科学家成功利用统计学方法鉴定酵母的细胞周期转录因子

    生物谷报道:现代的生物信息学技术已经使人类更清晰认识到生命的机制。最新一期PNAS报道了中国台湾学者李文雄(音译)最新研究成果,采用统计学方法成功鉴定出酵母的细胞周期中的转录因子网络。通过生物信息学手段成功预测了50个酵母细胞周期转录因子之间相互作用的规律。这一研究成果将为生物信息学在生命科学领域中的更深入应用提供更广泛的基础的。

生物信息学的应用解决了传统的生物学方法所不能解决的生命网络和系统生物学等问题。

专栏:系统生物学进展

Fig. 1. The regulatory behaviors of 50 known or putative yeast cell cycle TFs. The descriptions are from Tables 1, 2, 3, 4 and 9 and the literature. TF {alpha} in red (blue) means that genes in G{alpha} are expressed significantly higher (lower) than genes in G-{alpha}. TF in black means that, although it is not identified by the first method (detection of individual TFs), it is detected by the second method (detection of synergistic pairs). A TF filled with green means a known cell cycle TF, yellow means highly confident, and gray means plausible. An edge connecting two TFs implies that the two TFs are synergistic according to our analysis. An edge ({alpha},{beta}) in red (blue) means that TFs {alpha} and {beta} have positive (negative) synergy; plausible pairs are in thin lines, and highly confident pairs are in thick lines. A synergistic pair in green means supported by literature, and a synergistic pair in yellow means consistent with predictions of other studies.

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系统生物学专题:

·一种新的研究系统生物学的方法
·系统生物学的前沿--SYSTEMOSCOPE 
·从功能基因组系统生物
·有关专家呼吁:应尽快建设系统生物学平台
·解读系统生物
·系统生物学在免疫系统研究中的应用
·酵母膜表面蛋白相互作用的大规模研究
·利用RNAi技术对生命活动中的激酶进行大规模研究
·《Nature》:大规模绘制基因图谱的新方法 
·基因组时代基因网络调控
·基因网络图谱集
·PNAS:一种有前景的新基因网络分析方法
· 酵母的细胞周期网络调控异乎强大
·分析复杂细胞网络的新方法 
·酵母遗传作用网络图被揭示 
·从基因网络到基因功能的研究方法
·简化的布尔网络模型可以分析酵母的转录网络
·合作:生物信息学分析与信号传导网络研究
·调控网络的预测:利用基因表达的数据在全基因组范围内寻找转录因子的作用对象
·Cell:人类蛋白质间相互作用图谱被揭示

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