需要多少比较性基因组学信息才足够？

生物谷

生物谷报道：随着人类基因组测序工作的完成，遗传学家已经急不可待地开始对其他有机体进行测序，其部分原因是想知道种间哪些DNA区域具有相似性并且因此可能具有重要的功能。但是，这些研究又引发了一个重要的问题：需要完成多少个物种的测序才能知道是否进化过程保留下来了一个特定的DNA片断。在发表在2005年1月的PLoS Biology上的一篇文章中，霍华德休斯医学研究所的Sean R. Eddy给出了一个能够详细解答这个问题的数学模型。

根据Eddy的模型，问题的关键是确定应该测序哪些物种。对多个物种进行比较以确定被保存下来的DNA基础。还有，有机体在进化过程中的亲缘关系越近，则越需要进行比较从而得知一个给定的DNA区域是否在种间得以保留。

这个模型发现检测变异的单个核苷酸将需要比较大约17个平均进化分隔距离像人和老鼠一样的基因组。但是，当被保留的核苷发生变化则需要测定25个基因组。

这个模型能够成功模拟真实核苷酸的进化模式。它还能精确预测现有基因组比较的结果。这项研究将有助于指导人们思考如何利用比较性资料以及到底需要多少资料（http://www.bioon.com/）。