生物信息公司介绍
基因组能力体现在它新颖的专有的ProteoGraphTM和ROSETTATM技术上，这些技术提供了直接的蛋白确定和测序能力，从而将基因、蛋白、和疾病过程相联系。
对每一个样品，OGS利用ROSETTATM软件在数据库中记录它所有的来源信息，可以通过其唯一的条形码进行检索。然后这些样品被分解成他们的组成蛋白，以数码图像的形式将其蛋白表达图谱得到。OGS利用这些数码图像可以自动的进行大量疾病和参照样品的比较，从统计学的角度获得大量蛋白中存在的显著差异。这个过程的结果可以通过ROSETTATM软件用图表的形式显示。蛋白质的确定过程是高度自动化的，感兴趣的蛋白被分离，打断成许多的肽段。单个片断的氨基酸序列被测定以后，通过专有的程序（是ROSETTATM软件的组成部分）同蛋白质和基因组数据库进行比较。没有被确定的氨基酸序列被重新测定。
Oxford Molecular Group
2105 So. Bascom Ave
Campbell, California 95008
Tel: 408 879-6300 Fax: 408 879-6302
e-mail: products@oxmol.com
web site: www.oxmol.com
技术
Oxford Molecular为化学制药的开发研究和生物技术研究者研制开发软件工具，已开发的软件产品种类有：生物信息学方面、桌面化学处理系统、分子模型方面、毒物学、化学数据库以及企业规模的数据处理系统。
Oxford Molecular的生物信息学产品如下：AcM是为与人体免疫系统相适应的人体抗体而设的一系列程序。BIONET是通向高性能计算机上强大的序列分析和数据库搜索工具的在现服务。Chameleon是一种3D的序列队列模拟系统，提供了序列和结构之间的动态显示。GENESEQ是一种内含超过200，000中非专利的DNA和蛋白序列的数据库，MacVectorTM和AssemblyLIGNTM通过通向Entrez数据库的网上途径进行DNA和蛋白序列数据的操作，MPSRCH是在MasPar大型并行计算机上配合高通量DNA和蛋白搜索工具Smith-Waterman程序运用而设立的，OMIGA是一种覆盖了所有序列分析中问题工具：多重alignments分析、motif扫描等等。SPS Cross_Match软件用于提高两组DNA或是蛋白序列的比较速度。SPS Phrap利用标准的硬件设备提高汇集能力，SPS SWAT利用标准硬件提高多重序列分析能力。Wisconsin是用于企业规模的序列分析和数据库处理的综合性标准数据库软件包。
Oxford Molecular的化学信息学产品如下：RS3 Discovery允许化学结构的储存、搜索和重建，RS3 HTS是对高产量的测试试验的数据进行储存和分析的工具，CSAPTM是一种高工量的易用的测试工具，用于组织微型板、程序、测试数据、化学成分和数据分析。Chemical Information System是通向30多个重要化学和环境学数据库的在线服务，DIVA可以将电子数据表模型的成千行的化学结构和特性信息的数据，进行可视化和进一步分析。Kekul是一种分子绘制程序，通过与ISIS, ChemDrawTM和其他通用程序的简单整合，可以与扫描仪一起用于将打印的文件转化成计算机可读的电子模型。
Pangea Systems, Inc.
Lake Merit Plaza
1999 Harrison Street, Suite 1100
Oakland, California 94612
Tel: 510-628-0100, and 800-7PANGEA Fax: 510-628-0108
e-mail: services@pangea.com
web site: www.pangeasystems.com
技术
Pangea系统为开发生物制药工业药物开发中的生物信息学工具、数据库以及服务。Pangea配合常规的方法进行研究项目的跟踪、大量科学数据的自动化分析和评注、从大量的来源中整合进新的和已存在的数据。Pangea的应用软件和数据设置能够作为独立的项目或是完全互相整合或是与客户已有的程序相整合。Pangea的程序与所有的计算机平台都兼容，与工业标准的软件和数据库流畅的执行，程序的操作能够被经过初步培训的职员所掌握。Pangea系统提供了技术产品支持、计划和安装、系统整合、维护和专业的服务及咨询。
Pangea的应用软件对于公开的和私有的数据都有用，GeneMill 2.0作为一种序列克隆库和工作流程管理系统，是为专门的测序实验室设计的。GeneWorld 3.5是自动的、灵活、高通量的应用程序，用于分析和处理DNA和蛋白质的测序数据。
Pangea的计算工具包括：收集和排列工具，用于从表达序列标签和片断序列的信息中重建出全长的基因序列。Pathway工具是用于建立、查询、分析、和拓展综合的传导途径和基因组数据库的。
Paracel, Inc.
80 S. Lake Ave., Suite 650
Pasadena, California 91101-2616
Tel: 626-744-2000 Fax: 626-744-2001
e-mail: info@paracel.com
web site: www.paracel.com
技术
Paracel开发和销售以制药、生物技术和政府市场为对象的高效的基因组数据分析系统。Paracel最初建立于1992年，是从TRW派生出来的，公司已从原先的先进的过滤技术发展到数百种高效的硬件系统。
Paracel用于加快基因组数据分析的最新的系统：GeneMatcherTM，是特别为大范围的序列同源搜索而设计的，它运用最灵敏的动态程序运算法则，以惊人的速度进行数据相似性的分析。Paracel的软件产品：BioView ToolkitTM和BioView WorkbenchTM是用户可以方便的在GeneMatcher上从各种网络计算机平台上进行标准的常规搜索。
PE Informatics
1660 Old Pecos Trail, Suite D
Santa Fe, New Mexico 87505
Tel: 888- 644-6300 or 800-345-5224
e-mail: cortezad@perkin-elmer.com
web site: www.peinformatics.com
技术
PE的信息学产业提供了整合的程序方案、服务、情报以加快研究和开发的进程。PE Biosystems是PE公司的生命科学分部，它的建立加快了制药业、诊断学、人的鉴定、食品和环境测定、农业以及基础研究的进展。
BioLIMSTM软件是为ABI PRISM DNA测序仪而编写的，用于进行自动化的数据收集、分析和处理的生物信息学产物。BioMerge是一种多平台的，客户/服务器用于数据分析的信息软件系列，也可以提供集成的公共的和私人的数据。
SQL*GTTM是进行DNA样品追踪的软件程序，利用上游样品和流程的管理来注册样品信息、管理工作流程、产生样品说明页并追踪样品。它同ABI PRISM遗传分析系统相整合，并与其它的PE信息学产品完全兼容。
BioLIMSTM软件是用于遗传数据的收集、自动化的分析、样品分析列表的产生、监控数据的完整性。BioMerge软件是一种下游数据的整合分析工具，用以更新多来源的数据，使数据的分析、分拣和可视成为自动化。
PE Informatics的专业服务部门为客户的需要开发常规的程序，包括：数据库的注册建立、系统的注册、网络协议和项目管理。服务内容包括：现有系统的定点整合，工作流程分析，系统优化，数据迁移，程序管理，系统升级，系统维护，系统定制以及特殊用途程序的开发。
Structural Bioinformatics, Inc.
10929 Technology Place
San Diego, California 92127
Tel: 619-675 2400 Fax: 619 -51 3828
e-mail: sburgess@strubix.com
web site: www.strubix.com
技术
Structural Bioinformatics Inc. (SBI) 通过缩小基因序列和药物开发间的差距，加快了新药的研发。新药主要成分的开发是运用蛋白质的结构信息在小分子数据库中搜索出潜在的活化组分，它的同源模型和特有的环形法则是基因序列信息产生可能的蛋白结构。然后在SBI专有的DynaPharmTM技术的帮助下，蛋白质的结构特征可以被用来在化学数据库中进行检索。通过同CombiLibTM数据库（容易合成的候选药物数据库）的联合，它为药物主要成分的研发提供了快速有效的方法。
在1999年，SBI将启动它的第一个生物信息学产品：SbdBaseTM，一个疾病基因的蛋白产物的结构及其分析工具的数据库。SbdBase为模型工作者、化学家、和分子生物学家提供了从桌面通向专业的蛋白质模型的途径，并带有其分析工具。
ZymoGenetics, Inc.
1201 Eastlake Avenue East
Seattle, Washington 98102
Tel: 206-442-6600 Fax: 206-442-6608
e-mail: hr@zgi.com
web site: www.bio.com/co/co.html
技术
它的Biomolecular Informatics Department将数据库分拣、分子建模和核酸化学联合起来，在公开和商业化的数据库的cDNA和基因序列中寻找新的蛋白。蛋白结构的专门技术使得ZymoGenetics的科学家们能够找出有希望成为药物靶位点和药物蛋白的序列，以这些序列作为出发点的一系列研究阐明了这些基因所编码的蛋白的活性、生理角色以及可能的药物作用。
Paracel用于加快基因组数据分析的最新的系统：GeneMatcherTM，是特别为大范围的序列同源搜索而设计的，它运用最灵敏的动态程序运算法则，以惊人的速度进行数据相似性的分析。Paracel的软件产品：BioView ToolkitTM和BioView WorkbenchTM是用户可以方便的在GeneMatcher上从各种网络计算机平台上进行标准的常规搜索。
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