Mitrionics携手SGI展出开源加速生物信息程序

生物谷

    23日，Mitrionics;  Software  Acceleration  Platform  及Mitrion  Virtual  Processor的发展商Mitrionics;  AB与SGI®在第十五届分子生物学智能系统国际会议(ISMB)及第六届欧洲计算生物学会议(ECCB)上展出其最新开源软件技术──FPGA加速生物信息程序。

    在2007年7月20至25日奥地利维也纳举行的会议期间，Mitrionics将在摊位内展出Mitrion  Development  Platform、Mitrion  Virtual  Processor和最新推出的Mitrion-accelerated  NCBI  BLAST-n生物信息程序。

    Mitrion  Accelerated  NCBI  BLAST结合了三大卓越组合，包括：Xilinx省电强力的FPGAs、SGI®  Altix®服务器的超快内存副系统及Mitrion  Virtual  Processor，其运作速度远胜其它产品。在单一FPGA上持续运作的速度，比利用2.8GHz  双核心  AMD  Opteron  处理器的8220  SE.(1)单核运作快60倍。

    之外，2007年生物信息开源会议(BOSC  2007)上，Mitrionics的高级软件工程师Henrik  Abelsson介绍到，Mitrion加速BLAST开源程序及Mitrion-C  Open  Bio  Project如何能够利用开源程序进行发展，并对生物信息族群做出贡献。而Henrik  Abelsson本人也是Mitrion-accelerated  BLAST  程序的主要开发人员。

    Mitrionics  AB行政总裁Anders  Dellson表示：“Mitrionics的开源加速BLAST程序利用了SGI的RASC系统，并已正式在各处投入服务。合并方案为业界就纯正的处理性能及超低耗电量订立了全新基准，更能为  全球研究所及制药公司的基因学研究带来实时好处。”

    SGI科学发展经理Michael  Brown称，Mitrion加速BLAST-n利用SGI  RASC生物信息器材，能使速度提升60倍以上。用户只需更改BLAST-n资源码的0.2%，便能取得这种效果。特别对于计算密度要求更到的程序，更能体现其有点。

    而对于利用Mitrion  Virtual  Processor  带来BLAST优化，分析人事认为，能进行大规模平衡处理的Mitrion  Virtual  Processor  (MVP)是Mitrion  Platform的核心所在，这也是全新加速Mitrion-BLAST的重要组成部分。
    MVP及其相关软件全部由Mitrion-C编程语言开发，基于FPGAs语言写成，所以程序员无需掌握硬件设计技巧，也能轻松使用。

    Mitrion  Virtual  Processor的结构独特，能因应运作程序而调教，发挥最佳性能，更可大幅减低发展FPGA加速软件的总成本。更重要的是，本处理器让整个超级计算机业界都能受惠于FPGA的程序加速技术。

    SGI  |  Innovation  for  Results™简介

    SGI  (纳斯达克：SGIC)专门发展高性能计算机，在业内首屈一指，能提供一系列高性能服务器及储存方案，并其它业内尖端专业服务，又能支持客户应付复杂的密集信息工作流程，加快突破性的发现、创新及信息更新。

    SGI方案协助客户解决计算机应用带来的问题，包括：透过药物研究提升生活水平、设计及生产更安全有效的汽车与飞机、研究全球气候、提供国土安全及国防所需科技，或协助企业管理大量信息等。

    Mitrionics  简介
    Mitrionics,  Inc.于2001年正式成立，是FPGA超级计算机的业内翘楚。FPGA超级计算机为近年新兴发展，能提升处理器能量，减少能源消耗，比计算机系统群组更胜一筹。

    该公司的Mitrion  Virtual  Processor  及Mitrion  Software  Development  Kit让客户能利用FPGA超级计算机技术，管理关键程序，而且符合成本效益，经济实惠。而Mitrion  Platform更是个独一无二的FPGA程序方案，其设计减低了对电路设计技术的要求，令新兴市场内所有科学家与发展商都能享用FPGA超级计算机的优越性能。

    Mitrionics与Cray、  Nallatech及Silicon  Graphics  均已建立重要业务联系。