聚焦“孤儿”基因簇

   

( 生物谷配图)
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    许多微生物的基因组序列都编码一些假定的生物合成基因簇，但是相对应的天然产物却一直没有确定出来。最新一期的Chemistry  &  Biology杂志的封面图片则呈现了一种分离和描述这些“孤儿”基因簇产物的一种全新方法。

    这张图片的背景是植物根上假单胞菌荧光Pf-5细胞显微照片，DsRed荧光蛋白将植物根可视化。这种假单胞菌荧光Pf-5细胞还能够在纯培养物中生长，并且它的完整基因组已经知道。 

     通过生物信息学方法，研究人员推测出一个基因组中的“孤儿”基因簇编码一种lipopeptide产物，以确定出对应的天然产物的前体，而该天然产物则被氮15和fed所标记。
    顺次，这种同位素标记能够利用核磁共振仪观察到，进而知道分离和最终新lipopeptide的结构确定。研究人员将这种lipopeptide给了俗名——orfamide  A。

    这篇文章的作者是美国加州大学、俄勒冈大学等高校的研究人员，文章的通讯作者是Joyce  E.  Loper。

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