Nucleic Acids Res.：揭示RNA所起细胞作用的计算机程序

计算机工程师可能给医学界提供一种精确计算出蛋白质如何形成和发挥功能的新方法。美国中佛罗里达大学助理教授Shaojie Zhang使用一种复杂的计算机程序分析RNA基序，即组成RNA的亚单元。RNA与DNA和蛋白质是生命的三种构建单元。知道这三种构建

PNAS：心房肌细胞钙浓度数学模型建立

近日，诺丁汉大学的研究人员首次建立了心脏心房细胞里钙离子活动的数学模型，这将有助于提高心脏疾病和中风的治疗机会。这项突破带领科学家进入一个细胞活动的世界，打破了当前成像技术。研究结果发表在 PNAS杂志上。心跳实际上是由上百万个肌肉细胞协调行动的结

Science：从宏基因组数据中分离出单个物种基因组序列

从由细菌、古细菌和病毒组装的错综复杂宏基因组DNA序列中，研究人员获得一种神秘的广古菌的整个基因组序列。图片来自Vaughn Iverson/华盛顿大学。宏基因组学(metagenomics，译者注：也常译作环境基因组学)就是取样---一勺泥土或一

Nature：细菌群感效应成就“生物像素”传感器

1月5日，国际著名杂志Nature刊登了国外研究人员的最新研究成果“A sensing array of radically coupled genetic ‘biopixels’。”，文章中，作者揭示了一种基于“生物像素”的传感器。第一批合成生物

Nat Methods：蛋白序列比对新工具HHblits更快更准

近日，来自德国慕尼黑大学的研究人员在Nature Methods杂志上发表论文HHblits: lightning-fast iterative protein sequence searching by HMM-HMM alignment介绍一种

Nat. Methods：德发明蛋白序列比对新工具——HHblits

近日，德国慕尼黑大学的研究人员发表论文介绍一种能提高蛋白序列比对分析的新工具：HHblits。相关成果公布在《自然—方法学》（Nature Methods）杂志上。HHblits是一种能极大增加蛋白功能性分析技术的软件，能通过新颖的序列寻找方法，更

Evol Bioinform：于军等构建“脊椎动物进化分支共调控基因数据库”

近日，国际著名杂志Evolutionary Bioinformatics 刊登了中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室的最新研究成果“LCGbase: A Comprehensive Database for Lineage-Base

Sci.Sig.：抑制肉芽肿炎症的信号通路

研究人员发现了可抑制肉芽肿性炎症反应的信号通路，该研究或可为自身免疫性疾病的治疗提供新思路，其相关论文近日发表在《科学-信号转导》（Science Signaling）杂志上。肉芽肿的形成是机体抗细胞内细菌的一个重要机制，但过度的肉芽肿性炎症反应会

Nat. Biotechnol.：新银河系统利用“云”分析DNA

11月8日，据美国物理学家组织网报道，美国宾夕法尼亚州立大学和埃默里大学的研究人员开发的新银河（Galaxy）系统，能利用“云”实现科学家对于与DNA（脱氧核糖核酸）测序和分析等相关软件工具的“驾驭”，并存储大量科学数据。相关研究进展将发表在《自然

Nat. Biotechnol.：计算机可操控酵母菌内特定基因开关

据英国广播公司（BBC）11月6日报道，瑞士科学家在最新一期《自然—生物技术》杂志撰文指出，他们成功地在计算机和普通酿酒酵母之间形成了一个“反馈环”，可用计算机精确地控制酵母菌内特定基因的打开和关闭，这项创新方法可对利用微生物制造生物燃料或抗体等生

Sci Transl Med：新的成像软件能发现癌症

新的成像软件可能与病理学家的眼睛相媲美。研究人员创建了一种叫做“C-路径”的电脑程序，这种程序可对乳腺组织做显微图象的扫描以寻找6000种以上的癌症特征。该软件在2组妇女中帮助预测了乳腺癌的严重性，它可能是一种判断某位患者存活机会的有用工具。自19

PLoS ONE： 新海洋病毒可编码功能性miRNA

石斑鱼虹彩病毒编码的miRNA研究取得进展中科院海洋生物资源可持续利用重点实验室（依托于南海海洋研究所）秦启伟研究员领导的团队，在海洋病毒编码的miRNA研究方面取得突破性进展。团队成员闫阳博士等首次鉴定并验证了一种新的海洋病毒——石斑鱼虹彩病毒能

Ann. Neurol.：利用脑电波能控制假肢

日本大阪大学研究人员日前在美国《神经学年鉴》（Annals of Neurology）期刊网络版上发表论文说，他们利用安装在运动麻痹患者脑部表面的电极，成功读取患者的脑电波，推测出其意图，从而使作为假肢的机器人动了起来。这一成果有望促进开发出帮助相

Mol. Microbiol.：链霉菌群体感应信号合成调控获进展

细菌能自发产生、释放一些特定的信号分子，并能感知其浓度变化，调节微生物的群体行为，这一调控系统称为群体感应(quorum sensing，QS)。细菌群体感应在细菌和宿主之间的相互作用中起着重要的调控作用。在链霉菌中，γ-丁酸内酯(gamma-bu

CEUS：模拟软件可提高车位的利用效率

现代城市中停车难的问题日益突出，它不仅为驾车者带来了困扰，也让本来就很糟糕的交通状况雪上加霜。据美国物理学家组织网11月1日报道，以色列和荷兰科学家日前开发出一种模拟软件，能够将与停车相关的因素都“考虑”在内，对现有情况进行评估测试，帮助市政管理人

Nat. Com.：细菌可开发生物计算机基本组件

英国研究人员最近用细菌和基因手段开发出一种可模块化的新型“生物逻辑门”，为研制生物计算机铺平道路。逻辑门是计算机的基础，它是一种对输入的信息进行逻辑运算，然后输出信息的装置。通过对不同逻辑门进行各种组合，就可搭建出复杂的计算机电路。英国帝国理工学院

Science：新合成基因系统有助了解生物图案形成

在自然界中，细胞组成重复的图案和结构往往是被精确控制的，而这种排列使生物长成不同的特定形状。例如，人类每只手只长五只手指，牛有两只，而马则只有一只。可是，这些结构是如何形成、原理是什么，对人类而言一直是一个迷。一个由香港大学、香港浸会大学、美国加州

Cell Research：研究Ras信号通路调控获进展

Ras信号通路是膜受体信号向细胞内传递的重要途径。除了在癌症的发生发展过程中发挥重要作用外，Ras信号通路参与调控了细胞一系列的基本生物学活动，包括增殖、凋亡、分化和衰老等。Ras信号通路的调控相当复杂。最近的研究发现，该信号通路在不同亚细胞位置的

Cell：研究发现白血病关键信号机制AKT/FOXO

来自麻省总医院再生医学研究所，哈佛大学等处的研究人员发现了白血病中一种关键信号机制，提出了AKT/FOXOs之前未知的新功能，为不同基因型的白血病患者的治疗提出新的思路。这一研究成果公布在《细胞》（Cell）杂志上。文章的通讯作者是哈佛大学干细胞研

Nucleic Acids Res.：成功研发GWAS数据网络分析平台ICSNPathway

继成功开发基于通路的全基因组关联研究（GWAS）数据网络分析平台i-GSEA4GWAS之后，中国科学院心理健康重点实验室王晶研究员和张昆林助理研究员等研究者又开发了网络分析平台ICSNPathway（Identify candidate Causa