BBRC:章张团队研究开发出DNA序列并行比对新工具
最近,中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室“百人计划”章张研究员,带领其团队成功开发出“编码蛋白质DNA序列并行比对工具—ParaAT(Parallel Alignment and back-Translation)”。该研究成果发表在《生物医药与生物物理研究通讯
Nature & Cell:利用新技术ChIP-exo发掘重要性基因调节
B. Franklin Pugh和Ho Sung Rhee开发并且一种新技术ChIP-exo能够精确地指出解读和调节染色体的蛋白质位置。图片来自宾夕法尼亚州立大学B. Franklin Pugh。美国宾夕法尼亚州立大学开发并且证实一种新技术能够对解读和调控染色体---细胞内携带基
The Scientist :《科学家》杂志2012年生物技术创新新
图片来自stock.xchng.com, Bernd89.Stephen Friend在我们2011年10月那期《科学家》杂志上写道:“当现存的基于症状的疾病分类被破解为它们基于组学(omics-based)的实际亚型,这样流行病学家将能够在追踪疾病上取得巨大突破。DNA对生物医
PNAS:调节生物钟节律的关键分子
(图片来源:Proceedings of the National Academy of Sciences)德州大学西南医学中心的Zheng Chen等近日在美国国家科学院院刊(Proceedings of the National Academy of Sciences)发表论
2010,高通量测序技术日渐成熟
测序在生命科学研究中一直发挥着重要作用。以Sanger法(双脱氧核苷酸末端终止法)为代表的第一代测序技术帮助人们完成了从噬菌体基因组到人类基因组图谱等大量测序工作,但由于其存在成本高、速度慢、通量低等不足,并不是后基因组时代最理想的测序方法。进入21世纪后,以Roche 454、
Nano Lett.:探测单个DNA分子技术 开启高通量DNA电子测
据外媒报道,美国宾夕法尼亚大学的研究人员近日开发出一个纳米级的碳基平台,可用于电子探测单个DNA(脱氧核糖核酸)分子。该技术最终有望在快速DNA电子测序方面发挥“用武之地”。相关研究论文发表于最新一期的《纳米快报》。这个纳米平台由石墨烯制成。研究小组利用电子束技术,在石墨烯膜上烧
Plant Cell:植物逆境硝酸根再分配调节作用
近期植物学研究权威期刊Plant Cell在线发表了植物生理生态研究所植物分子遗传国家重点实验室龚继明研究组最新研究成果:拟南芥NRT1.8基因介导的NO3-再分配在植物逆境胁迫耐受机理中起着重要的调节作用。硝酸根(NO3-)是陆生植物最重要的氮源之一,它不仅是重要的营养物质,而
Nature:褐藻(Ectocarpus)基因组测序完成
Ectocarpus(褐藻的一个模型生物)的基因组已被测序。褐藻是复杂的光合作用生物,它们已经适应了在沿海石质环境中生活。基因组分析为了解这种适应性提供了线索,并且还显示了一大类集光及色素生物合成基因和新颖的代谢过程(如卤化物代谢)。比较基因组分析突显了一组受体激酶和相关分子在植
Science:非洲爪蟾(Xenopus tropicalis)基因组测序完
专题:Science系列一个国际联合研究小组4月30日报告说,他们成功完成对一种非洲青蛙的基因组测序,这项成果有助于理解一些人类基因的基本功能。由美国能源部联合基因组研究所科学家乌费·赫尔斯滕领导的国际研究小组在30日出版的美国《科学》杂志上报告说,非洲爪蟾主要生活在撒哈拉沙漠以
Science:高通量技术分析染色体分离蛋白
染色体分离是有丝分裂和减数分裂的关键事件,是保证姊妹(同源)染色体正确分配到子细胞中关键的调控环节之一。近年来,利用酵母等真核模式生物突变体,研究人员克隆了一些调控细胞分裂早期姊妹染色体黏着和后期黏着素酶解的关键基因,初步阐明了染色体分离的分子调控机理.由多亚基蛋白组成的黏着素是
EBM:抗癫痫药物苯妥英(phenytoin)可稳定情绪
苯妥英(phenytoin)是一种全世界广泛使用的抗癫痫药物,最近在躁郁症病人的临床研究显示,和其他治疗躁郁症病人的抗痉挛药物如carbamazepine或valproate比较,苯妥英除了有抗痉挛的效果外,可能还多一个稳定情绪的作用。在2010年三月份实验生物及医学(Exper
基于哺乳动物单杂交技术ERα调节剂高通量筛选模型的建
生物工程学报 25 July 2009, 25(7):1088~1094基于哺乳动物单杂交技术ERα调节剂高通量筛选模型的建立及应用张倩1, 水小溪1, 范玉玲2, 郝伟丽1, 郑智慧1,2, 路新华2, 赵宝华1, 张华2, 贺建功21 河北师范大学生命科学学院, 石家庄050
Nature:来自海水中的新种类小RNA
专题:Nature报道小非编码RNA既见于微生物细胞,也见于真核细胞。大多数已知微生物小RNA的功能是,调控核心生理过程中所涉及的基因,但我们关于小RNA的知识一直仅限于在实验室中所培养的微生物。“环境转录组学”(Metatranscriptomics)是最近发展起来的一种技术,
PNAS:深海微生物新陈代谢多样性
一项使用GeoChip基因阵列装置的研究报告说,在海底热液喷口附近的微生物群落比此前认为的更加多样。Jizhong Zhou及其同事发现,生活在靠近Juan de Fuca 洋脊(位于太平洋靠近美国和加拿大西海岸附近)的海底烟囱附近的微生物表现出的遗传和代谢相似性很少。此前的研究
Nature Biotechnology:安捷伦寡核苷酸序列合成技术助
来自美国麻省理工学院和哈佛大学Broad研究院的研究人员,利用安捷伦(Agilent Technologies)卓越的寡核苷酸序列合成技术,合成大量生物素标记的RNA诱饵用于靶向序列的捕获,成功应用于高通量平行靶向测序。这一重大科学进展作为封面文章发表在最新一期的自然o生物科技杂
PNAS:蔷薇类植物9千万年前发生爆发式分化
国际著名期刊美国《国家科学院院刊》(PNAS)2月19日在线发表了中国科学院武汉植物园王恒昌博士和美国佛罗里达大学合作研究的研究论文:Rosid radiation and the rapid rise of angiosperm-dominated forests。现存大约30
Plant Physiol.:花粉萌发转录基因组研究
来自中国农业大学,国家植物基因研究中心,植物生理与生物化学国家重点实验室的研究人员利用Affymetrix拟南芥ATH1基因组芯片,全面分析了花粉萌发和花粉管生长过程中的转录组变化情况,发现了这个过程中一些重要变化。这一研究成果公布在Plant Physiol.杂志上。花粉萌发(
基因测序与基因组学在生物质转化方面的应用
利用先进的低成本、高通量基因组测序技术能够更好地研究自然界的生物质转化过程。丝状真菌(Filamentousfungi)是一类重要的生物过程微生物,能够生产多种有价值的产品,能够在较低pH值和较高产品滴度下生长,而利用的是六碳糖和五碳糖。该过程的关键问题是提高其中高值产品的产量,
华人科学家刘雄发现高通量分析蛋白质结构动力学的方法
生物谷报道:蛋白质结构的研究目前还处于极为初级阶段,它是揭示蛋白质的作用的最终的手段之一。但蛋白质结构的动力学更为复杂,目前有很多相关的学说。但是如何高通量预测与分析蛋白质结构动力学的方法还是十分缺乏。来自美国约翰霍普金斯的Wilmer研究所华人科学家刘雄(Xion
华人科学家刘雄发现高通量分析蛋白质结构动力学的方法
生物谷报道:蛋白质结构的研究目前还处于极为初级阶段,它是揭示蛋白质的作用的最终的手段之一。但蛋白质结构的动力学更为复杂,目前有很多相关的学说。但是如何高通量预测与分析蛋白质结构动力学的方法还是十分缺乏。来自美国约翰霍普金斯的Wilmer研究所华人科学家刘雄(Xion






