微生物群落对所有生态系统发挥正常功能至关重要;然而,绝大部分微生物不能被纯培养,它们在自然中的作用还不清楚.使用鸟枪法对来自自然界中嗜酸生物膜的DNA测序,我们重建了几乎完整的Leptospirillum group II 和Ferroplasma type II的基因组及部分恢复了其它三个基因组.这是完全可能的,因为生物膜受一个小数目的种群控制,基因重排和基因插入或缺失的频率相对较低.因为每一个阅读序列都来自不同的个体,我们就能决定单核苷多态性在菌株水平上异质的突出形式.尽管存在低变种丰度,Leptospirillum group II基因组单核苷多态性明显较低. Ferroplasma type II 基因组似乎由三个古老菌株组成,它们经历了同源重组组成一个大的相嵌基因组.每个生物的基因互补分析显示了碳氮利用和能量生成的途径,透视了生物在极端环境中生存策略.
请参阅:
GENE W. TYSON, JARROD CHAPMAN, PHILIP HUGENHOLTZ, ERIC E. ALLEN, RACHNA J. RAM, PAUL M. RICHARDSON, VICTOR V. SOLOVYEV, EDWARD M. RUBIN, DANIEL S. ROKHSAR& JILLIAN F. BANFIELD(2004) .nature,428, 37 - 43 http://www.nature.com/cgi-taf/DynaPage.taf?file=/nature/journal/v428/n6978/abs/nature02340_fs.html
