达尔文在1879年7月22日给J. D. Hooker的一封信中写道：被子植物快速的繁荣并很早多样化，真是“令人讨厌的神秘”。被子植物被认为是最近地质年代里最为繁盛陆生统治者。它起源于130－90百万年（mya）以前，而在100－70mya的时候就已经在生态环境中占据了主导地位。目前大约有250，000种现存的种类被发现，而实际的数目估计有两个这么多。在这个种群进化树里，即便在两个姊妹分枝中物种的数目也可能会有几个数量级的差异。当年达尔文曾努力尝试寻找导致被子植物多样化如此之快的原因，但最终不得不承认自己的努力是“可怜的徒劳”。
现在科学家们在综合前人在该领域研究结果的基础上，绘制出了被子植物种群进化的超级树（supertree）。他们选用质体内的rbcL基因来估算各个分枝事件发生的相对时间，并对得到的结果用可靠的化石做年代进行校正。通过对超级树的分析发现，越靠近现代，物种多样化的速度越快，而多样化速度的改变速率（可以类比为“加速度”）相对于时间几乎是一个常数。对各个子分枝的分析也发现了同样现象。看来进化树的所有等级都遵循相同的多样化规律(见图)。科学家们还对10个主要多样化速率转换事件做了检测，发现它们不是简单的归因于某几个关键的因素的作用，而是与一个更为复杂的环境因素相联系－－这反映了新物种的产生是生物性状和环境相互作用的结果。
Fig. One of 10,000 most parsimonious supertrees with dates obtained by used nonparametric rate smoothing transformation of maximum likelihood branch lengths from rbcL sequence data. The time scale was calibrated by using the split between Fagales and Cucurbitales at 84 mya. The strength of shading reflects diversification rates estimated as log (number of species)/age since split from sister clade. See Fig. 2 for a larger figure showing names of all terminal taxa. Diversification rates vary from low (yellow to orange) to high (red to black).
请参阅：
Jonathan Davies, Timothy G. Barraclough, Mark W. Chase, Pamela S. Soltis, Douglas E. Soltis, and Vincent Savolainen
Darwin's abominable mystery: Insights from a supertree of the angiosperms
PNAS 2004 101: 1904-1909; published online before print February 6 2004, 10.1073/pnas.0308127100
