赤潮对人体健康的影响，除了接触而引起皮肤不适，挥发性毒素还能对眼睛和呼吸道产生影响。更主要的是有毒赤潮产生的赤潮生物毒素通过食物链的传递作用，导致人类的中毒甚至死亡。在早期，由于人们对海洋赤潮生物毒素的认识水平有限，大量误食含毒的海产品而中毒身亡的事例报道较少，因此这类中毒事件很难有确切的统计数据。据统计，在全球范围内，大约发生过1,600次人类麻痹性贝类毒素（PSP）的中毒事件。在1962年之前，全球PSP中毒人数超过900人，死亡200人。
可含毒素的海洋生物除贝类外，还有虾、蟹、鱼类等海产品。研究还发现，尽管在欧美一些国家沿海经常出现有毒赤潮，赤潮区海产品的毒素含量也很高，但因这些国家有较完善的海产品监测、管理措施，自80年代后发生海产品食物中毒的事件较少。而在亚洲等一些欠发达地区，对赤潮区海产品尚缺乏强有力的监测管理措施，食用贝类而导致中毒的事件时有发生。
我国包括台湾、香港在内，自60年代至今，有近600人因误食有毒的贝类而中毒，29人死亡。根据中毒症状及肇事藻种类，可推测大部分为PSP中毒事件。在南海海域，CFP另一类主要毒素。
应加强我国赤潮毒素的监测与管理工作，减少藻毒素对人民生命健康的威胁。
