蛋白质结构型的定义和识别

李晓琴,罗辽复

内蒙古大学理工学院,呼和浩特01002

提出紧结构域的概念 ,由二级结构序列中一段或几段连续的α螺旋和 β折叠构成的空间紧密堆集的最大折叠体称为紧结构域 .利用 3种紧结构域 (α域 ,β域和α/β域 )定义球蛋白的 5种结构型 :α型蛋白 ,β型蛋白 ,α/β型蛋白 ,多域蛋白和 ζ型蛋白 .将 12 6 1个代表性的蛋白质 (10 2 2家族 )进行分类 ,并和SCOP库的分类做了比较 .进行了删去序列冗余的分析 .在此基础上提出结构型的预测方案 ,成功率在 82 %～ 85 %. 。