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基因组筛选法研究结肠癌

基因组筛选法寻找人体结肠癌中受脱甲基和组蛋白去乙酰酶抑制剂上调控制的基因

作者:Suzuki H, Gabrielson E, Chen W, Anbazhagan R, Van Engeland M, Weijenberg MP, Herman JG, Baylin SB.

单位:The Sidney Kimmel Comprehensive Cancer Center at Johns Hopkins, 1650 Orleans Street, Baltimore, Maryland 21231, USA.

基因启动子异常的多重甲基化是癌症中肿瘤抑制基因失活的主要机制。我们先前已经证明该转录抑制可以通过甲基化和组蛋白去乙酰酶的作用而加以调节,甲基化占主导作用。这里,我们用cDNA基因芯片分析法来筛选人体结肠癌中表达逐渐沉默的基因。筛选10000多条基因后,我们证明此法能鉴别给定的一种癌症中大量启动子多重甲基化的基因,它们与启动子未甲基化的基因差别很大。后者表达上调仅受组蛋白去乙酰酶抑制子控制。我们鉴定的大多数多重甲基化基因,根据其预知的功能和在染色体上的位置来判断,都很可能引发肿瘤。我们还鉴定了一组基因,在结肠癌和胃癌中优先多重甲基化。其中SFRP1属于一基因家族,我们证实此家族中的4条基因在结肠癌中发生多重甲基化的频率很高,据此有望(I)发现独特的潜在机制使肿瘤抑制基因功能丢失(ii)建立分子标志群检测所有的结肠癌。

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