基因活动的计算机模型开发成功

生物谷

虽然人类认识大肠杆菌( Escherichia coli )这个微小的生物，已经有超过50年的时间了，但直到最近，加州大学圣地亚哥分校的科学家，才首度开发出，以计算机模型模仿大肠杆菌因应外界刺激后，基因活动调节的分析仿真系统。

该校主导这份研究的生物工程学系教授Bernhard Palsson博士，在2000年时就开始试图设计出大肠杆菌的代新陈代谢模型，他所带领的研究团队，首先必须收集了解所有和杆菌代谢有关的基因和蛋白，之后研究人员锁定1010个基因，其中包含104个调节性基因(regulatory gene)，设计出初步菌体活动基因代谢的模型，接着研究人员利用特定基因剔除的菌株，分析该菌株在缺氧( oxygen deprivation)下，基因活动的改变，再配合以基因芯片设计高通量(high-throughput)实验所获得的数据，不断的修正计算机所设计出来的代谢模型，尝试以模型预测真实生理反应可能存在的状况。

研究人员藉由这个方法，至少获得了超过115个，先前所未知的基因调节机制，目前该团队正尝试着把模型的对象，扩大至像酵母菌等单细胞生物，将来更有可能发展出小鼠，甚至于人类细胞的代谢模型。