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    iMol
    运行环境: Mac OS X 文件大小: 868 K
    软件等级:  软件类别: 国外软件
    开 发 商: Piotr Ro… 软件语言: 英文
    相关链接: 下载演示地址  下载注册地址 软件属性:    热   
    下载次数:      授权方式: 免费版
    解压密码: 
    软件添加: 审核:program 录入:program 添加时间: 2004-8-8 18:21:00

    ::下载地址::
    下载地址1  
     

     

    ::软件简介::
    iMol is a free molecular visualization application for Mac OS X operating system. The program is an indispensable tool  for chemists and molecular biologists. iMol allows loading molecules using several file formats: PDB, XYZ, MOL2, HIN, CAR, ALC, BIO. The molecules can be saved as PDB, XYZ or BIO files. The BIO file stores all view and rendering settings (e.g. colors, lighting, orientation of molecules). iMol can easily handle both small and large molecules, it can load multiple molecules, move and rotate them independently.   

    iMol uses OpenGL graphics to display molecules. The molecules can be rendered using various styles: wires, points, Van der Waals spheres, balls and sticks, polygons,  strands, ribbon, cartoons, spring, tube, ladder. Individual atoms and/or residues can be selected and rendered independly. The rendering styles can be mixed up to visualize complex molecular systems in a more convenient way. There are several predefined color schemes available (e.g. residuum order, secondary structure, hydrophobicity), as well as custom colors. Also, different materials (e.g. plastic, metal, glass) can be used. The rendered images may be exported as a bitmap, as a PostScript file, or as a POV-Ray file.  

    The program can meaure distances, angles, and torsional angles between atoms.  Molecules can be superimposed and RMSD (Root Mean Square Deviation) between atoms coordinates can be calculated. Additionaly, protein chains can be structurally aligned to detect regions of high structural similarity. iMol can load multimodel PDB files and display them as a dynamics trajectory.   
    Several rendering effects are available, including automatic rotation, motion blur, depth cueing (fog), background gradient, perspective, and stereo projection (using both side-by-side and red/blue anaglyph methods). Various rendering parameters can be fine-tuned. Atoms and residues can be labelled using names and numbers. 

    iMol benefits from Mac OS X Aqua user interface. Rendering, view, and selection options are placed inside a convienient mobile drawer. The iMol package includes several example files demonstrating full rendering potential and visualization capabilites.  

    iMol supports QuickTime movie format for rendering molecular dynamics trajectories and molecular animations. The movies are efficiently compressed for web applications.   
     

    System Requirements 
    Mac OS X v.10.2 or higher (10.1.x should work, too)
    G3 400MHz processor or better
    128 MB RAM
    OpenGL accelerator (at least 8 MB of video RAM)
    5 MB of free disk space

    iMol was written in Objective-C and C. The source code counts over 15,000 lines. The program may be freely used and distributed, providing that you don't remove a copyright information. 

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