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美国公布癌症基因图谱绘制计划

美国政府13日公布一项癌症基因图谱绘制计划,旨在找到所有致癌基因的微小变异,从而为治疗各类癌症开创新天地。 

癌症是大多数发达国家仅次于心脏病的第二大“杀手”,60%的患者确诊后只能存活5年。癌症由细胞DNA中的变异和其他变化诱发,按基因变异区分有200多种。美国政府发起的“癌症基因图集”计划将针对不同癌症的所有基因变异进行系统分析。这一项目预计耗资1亿美元,由美国国家癌症研究所和国家人类基因组研究所联合进行。 

目前,科学家已破译了致癌基因变异中的一小部分,如导致乳腺癌及与某些类型卵巢癌有关的BRCA1和BRCA2、导致某类型肺癌的EGFR基因等,一些生物技术公司则开发了有针对性的药物。 

美国科学家指出,绘制癌症基因图谱有助于把研究人员从目前逐个追踪基因的大量劳动中解放出来,便于迅速设计和找到针对性抗癌药物。美国国家癌症研究所副所长安娜·巴克认为,这项计划“是生物医学研究中的一大转折点,也是药物治疗的一大转折点”。 

目前,美国研究人员还没确定从哪些癌症着手开始研究,但计划先小范围地从两三种癌症起步。研究人员将先从所需类型癌症患者中取样几百份,然后对照已完成的人类基因图进行分析,以寻找致癌变异。 

或许在不远的将来,癌症不再是令医学界头痛的疑难杂症。美国政府官员13日在华盛顿新闻俱乐部称,美国计划投资1亿美元实施“基因图谱绘制计划”——绘制所有与癌症相关的基因变化图谱。通过图谱发现所有致癌基因的微小差异,从而为医治各类癌症找出最有效的途径。 

这项计划由美国全国癌症研究所和美国国家人类基因组研究所共同进行,两家研究所都已承诺,将在3年的时间内各投资5000万美元作为研究经费,并计划在这3年探索初期,成功绘制出2~3种癌症类型基因。在“基因图谱绘制计划”后期,预计可以完成目前所发现的200多种类型癌症的基因图谱。据悉,这1亿美元科研资金来源于NCI和国家人类基因组研究委员会。 

美国癌症研究所新闻发言人吉弗·斯宾塞表示,目前尚无确定在探索初期,科研人员将最先研究哪几种癌症基因类型。 

美国健康遗传中心主席弗朗西丝·柯林斯表示,可以预见,“基因图谱绘制计划”将人类所有癌症相关的基因的蓝图绘制出来,是一起相当巨大的系统工程。 

据悉,目前科研人员已经绘制出了人类标准基因图谱。科研人员希望通过绘制癌症的基因图谱,寻找癌症基因与普通基因的差异。柯林斯表示,这些差异可以为癌症检测提供新的方法,了解癌细胞发生、发展的机制。在此基础上取得新的治疗方法,最后可以勾画出整个新型“预防癌症的策略”。并且,在“基因图谱绘制计划”中,科研人员可以共享研究获得的数据资料,包括某一特殊基因的突变、染色体重组、转位缺陷等。 

科研人员表示,目前,科学家已破译了致癌基因变异中的一小部分,如导致乳腺癌及与某些类型卵巢癌有关的BRCA1和BRCA2、导致某类型肺癌的EGFR基因等,一些生物技术公司则开发了有针对性的药物。 

美国国家癌症研究所副所长安娜·巴克说,“基因图谱绘制计划”是迄今为止世界上所进行的最大一项基因工程。安娜·巴克认为,这项“基因图谱绘制计划”差不多能抵上100多个“人类基因组计划”,在3年探索初期就要绘制出比“人类基因组计划”更多的基因图谱。 

通过应用基因组分析技术,特别是采用大规模的基因组排序,将人类全部癌症的基因组图谱绘制出来,这是癌症基因组学的一大主要内容,也是美国Cancer  Genome  Atlas(TCGA)项目将要实现的目标。TCGA打算对人类全部癌症的基因组进行测序。12月13日,美国国国立癌症研究所(NCI)和人类基因组研究所(NHGRI)分别拨款五千万美元,开始了TCGA项目的第一步工作,选择几个癌症病种进行癌症基因图谱的绘制,从而了解整个GCGA项目的可行性,这项工作称为TCGA试验项目。

TCGA试验项目的实施,目的是使科学家进一步清楚,要系统地找出并明确与癌症相关的基因变异及其它基因组变化这项工作所涉及到的科学难度和技术基础。至于选择什么样的癌症开始这个预实验,目前还在评估之中。

目前已知的癌症有200多种,但是,无论什么癌症,基因组变化在肿瘤不同分期或特殊类型的肿瘤上都有其特异之处,而正是基因组的改变导致了细胞路径的不正常,从而引发细胞生长不正常,通过TCGA项目,更深入地了解到导致这一过程的启始基因后,癌症预防、诊断和治疗方法的发展前景将建立在更加可靠的基础上。

NHGRI所长Francis  S.  Collins强调,考虑到癌症基因的复杂程度,TCGA试验项目给我们带来的挑战性是巨大的,通过癌症和基因组学研究领域精英的共同努力,我相信这个预试验将会获得成功。

NCI代理所长Anna  D.  Barker指出,在癌症医学研究领域,TCGA试验项目可以说具有革命性的作用,将对癌症生物学、基因组学技术、生物储藏库和生物信息学领域的最新成果得到协调发展和最佳应用。我们遇到的主要挑战将是癌症的复杂性问题和开发出使癌症基因组学的进一步发展的新技术。他强调,对癌症基因组学的研究将成为人类征服癌症事业上的一个必须要解决的问题。

TCGA试验项目的大致安排是这样的:人类癌症生物标本核心资源库(Human  Biospecimen  Core  Resource)将承担癌症组织标本和正常组织标本的采集、处理和分配工作,并由相关中心(Cancer  Genome  Characterization  Centers,Genome  Sequencing  Centers)采用高通量测序技术进行基因和基因组排序,该项目预计在2007年底完成。

据称,如同《人类基因组图谱》一样,这项工作获得数据将进入NCI和国家医学图书馆共同建立的一个公共数据库里,向全球开

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