DNA芯片在分子遗传学的研究领域中作用巨大：这包括：DNA测序、突变检测、基因筛选、基因诊断及几乎所有的应用核酸杂交的领域[11]。
DNA芯片用于肿瘤生物学更是得力的武器，首先，它可以检测肿瘤组织在表达上变化的基因。将已知的cDNA或其探针按前述方法在硅片或玻璃上列阵排布，再用两种荧光进行待检测组与对照组的cDNA或其EST探针的标记。两种材料一起与芯片杂交后，每一种单独表达的基因位点就会显示单独的颜色，而两种基因组同时表达的基因位点则显示其混合色，通过颜色在亮度上的差别还可鉴定每一种基因表达的相对丰度。DNA芯片的应用在这一领域中显示出极大的优越性。Affymetrix公司的一项研究表明对每一个基因只需20个左右的探针对即可对其表达进行准确检测。而通常一块芯片可以进行10000个以上的基因的检测，斯坦福大学的Brown与NIH的Trent两个小组用通过制作在载玻片上cDNA探针的微列阵，用以比较肿瘤细胞与正常细胞在基因表达模式上的差别。准确地检测到了与肿瘤发生相关的下调和上调表达的基因。其次，在DNA水平上，DNA芯片技术可进一步与前述的比较基因组杂交（CGH）等手段结合在一起，从而大大提高上述技术的效率，除此之外，芯片技术在DNA研究的其他领域也体现出其先进性与快速的特点，如肿瘤的基因诊断，目前用于乳腺癌基因BRCA1突变检测和对乳腺癌进行诊断的DNA芯片已经开发出来并已进入市场，其检测效率可达到99%以上。
90年代是各种学科和技术相互渗透、交叉发展的时间，对于肿瘤的发生以及治疗这一医学界与科研领域的难关，人们开始以一个全局观念去思考，可以相信在不久的将来，这些以多门学科、多项技术相互融合产生的工具和手段将对揭示肿瘤发生的根本机理起到不可估量的作用，肿瘤的根本治疗也将基于其发生机理的清晰而成为现实。
参考文献
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10 abbott A,Nature,1996;379(6564):392
11 cole KA et al,Nat Genet,1999;21(1 Supp1):38
